81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17680 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  400  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  52.98 
 
 
202 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  54.66 
 
 
220 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  49.1 
 
 
201 aa  142  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  50 
 
 
222 aa  138  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  50 
 
 
254 aa  136  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  50.32 
 
 
338 aa  132  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  48.28 
 
 
223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  50 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  50.67 
 
 
163 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  44.51 
 
 
179 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  45.89 
 
 
357 aa  121  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  45.57 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  40.98 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  50 
 
 
202 aa  119  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  44.94 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  49.42 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  49.66 
 
 
199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  46.67 
 
 
183 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  46.67 
 
 
183 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  46.11 
 
 
183 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  41.07 
 
 
192 aa  111  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  42.86 
 
 
220 aa  111  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  43.33 
 
 
191 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  49.66 
 
 
226 aa  111  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  45.39 
 
 
160 aa  111  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  50.68 
 
 
216 aa  106  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  47.79 
 
 
137 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  46.85 
 
 
167 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  39.89 
 
 
174 aa  99  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  40 
 
 
198 aa  94.7  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  41.04 
 
 
257 aa  88.6  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  36.96 
 
 
229 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  40.54 
 
 
170 aa  86.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  33.9 
 
 
227 aa  85.5  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  32.7 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  46.85 
 
 
127 aa  83.6  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  40.54 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0285  hypothetical protein  40.94 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.315039  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  34.53 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  32.72 
 
 
167 aa  67.8  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  28.48 
 
 
159 aa  67  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  34.68 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  27.89 
 
 
210 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  34.93 
 
 
225 aa  62.8  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  29.7 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10730  hypothetical protein  31.58 
 
 
177 aa  59.3  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0103312  unclonable  0.00000000098721 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26893  predicted protein  31.43 
 
 
296 aa  57  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.975242  normal  0.41218 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  25 
 
 
212 aa  54.7  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  27.59 
 
 
151 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  29.93 
 
 
214 aa  52.8  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  25 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  30.72 
 
 
214 aa  51.6  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  31.88 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  29.85 
 
 
162 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  28.47 
 
 
160 aa  49.7  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  27.56 
 
 
159 aa  49.3  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  25.71 
 
 
214 aa  49.3  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  31.82 
 
 
156 aa  48.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  34.03 
 
 
149 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02685  putative transcriptional regulatory protein  22.39 
 
 
159 aa  46.6  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392987  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  38.54 
 
 
161 aa  46.6  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  27.16 
 
 
178 aa  45.8  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1618  regulatory protein RecX  42.47 
 
 
225 aa  45.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000117054  hitchhiker  0.000000000911842 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  32.12 
 
 
154 aa  45.1  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1433  recombination regulator RecX  33.73 
 
 
191 aa  44.7  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.130729 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  26.03 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  26.49 
 
 
152 aa  44.3  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  33.71 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  26.99 
 
 
270 aa  43.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  24.65 
 
 
267 aa  42.4  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4684  regulatory protein RecX  29.73 
 
 
157 aa  42.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  30 
 
 
217 aa  42.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  28.17 
 
 
270 aa  42.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3947  regulatory protein RecX  29.5 
 
 
153 aa  42.4  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  22.88 
 
 
165 aa  42.4  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  22.9 
 
 
151 aa  42  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  21.43 
 
 
198 aa  41.6  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  32 
 
 
157 aa  41.6  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  30.23 
 
 
222 aa  41.6  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1832  regulatory protein RecX  34.58 
 
 
172 aa  41.2  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>