151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1042 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  100 
 
 		 176 aa  345  1e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  49.66 
 
 		 217 aa  134  8e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  40.99 
 
 		 338 aa  105  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  40.14 
 
 		 194 aa  98.6  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  41.4 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  43.2 
 
 		 216 aa  95.5  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  40.54 
 
 		 205 aa  92.8  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  40.82 
 
 		 202 aa  89.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  37.24 
 
 		 198 aa  88.6  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  37.75 
 
 		 191 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  34.97 
 
 		 192 aa  84.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  37.09 
 
 		 184 aa  84.3  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  39.73 
 
 		 220 aa  84.3  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  37.58 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  38.06 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  35.48 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  37.32 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  35.46 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  32.87 
 
 		 210 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  34.81 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  38.46 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  40.82 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  35.81 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  35.81 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  35.81 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  35.14 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  36.05 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  36.73 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  31.08 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  34.51 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  34.62 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  37.76 
 
 		 199 aa  70.9  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  33.77 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  38.46 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  32.21 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  25.61 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  33.79 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  31.08 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  31.65 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  25.97 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  29.8 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  23.53 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  34.21 
 
 		 221 aa  62  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  31.76 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  24.83 
 
 		 206 aa  60.8  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  29.79 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  35.66 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  34.06 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  37.29 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  32.61 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  33.09 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  27.69 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  23.56 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  27.03 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  27.14 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  23.9 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  21.13 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0285  hypothetical protein  33.1 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.315039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  25.47 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  34.53 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  25.17 
 
 		 270 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  25.17 
 
 		 270 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  25.17 
 
 		 270 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  32.17 
 
 		 225 aa  53.9  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  31.65 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  32.19 
 
 		 153 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  25.17 
 
 		 270 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  35.54 
 
 		 137 aa  53.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  32.61 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26893  predicted protein  27.54 
 
 		 296 aa  53.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.975242  normal  0.41218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  33.58 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  32.61 
 
 		 156 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  32.64 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  25.62 
 
 		 214 aa  52  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  25.81 
 
 		 214 aa  52  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  24.49 
 
 		 270 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  24.49 
 
 		 270 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  24.49 
 
 		 270 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  26.25 
 
 		 214 aa  50.8  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  28.67 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3947  regulatory protein RecX  33.12 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  23.9 
 
 		 270 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  30.5 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  23.9 
 
 		 270 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0020  regulatory protein RecX  32.84 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3722  regulatory protein RecX  26.28 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.658929  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  23.81 
 
 		 270 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0441  regulatory protein RecX  31.21 
 
 		 262 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  28.89 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0807  regulatory protein RecX  26.6 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  24.49 
 
 		 152 aa  48.9  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02685  putative transcriptional regulatory protein  24.06 
 
 		 159 aa  48.1  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392987  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1022  regulatory protein RecX  26.45 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  27.92 
 
 		 269 aa  48.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0651  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 285 aa  48.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  30.66 
 
 		 156 aa  48.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  35.82 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  31.16 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  29.88 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2438  regulatory protein RecX  25.6 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000098324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>