88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1461 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  100 
 
 		 223 aa  431  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  77.56 
 
 		 160 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  55.84 
 
 		 338 aa  145  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  54.22 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  52.9 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  45.55 
 
 		 202 aa  134  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  52.15 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  45.03 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  48.82 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  49.7 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  49.67 
 
 		 220 aa  128  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  47.59 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  41.71 
 
 		 254 aa  123  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  44.81 
 
 		 192 aa  121  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  44.58 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  43.62 
 
 		 357 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  47.2 
 
 		 163 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  46.01 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  41.94 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  41.92 
 
 		 184 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  43.04 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  45.45 
 
 		 257 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  42.86 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  40 
 
 		 174 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  42.17 
 
 		 183 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  42.76 
 
 		 202 aa  92  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  42.17 
 
 		 183 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  41.57 
 
 		 183 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  44.44 
 
 		 199 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  39.88 
 
 		 170 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  42.14 
 
 		 167 aa  88.6  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  44.37 
 
 		 137 aa  87  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  37.93 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  35.52 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  27.85 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  32.41 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  33.77 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  33.09 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  26.75 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  26.28 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  27.46 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  28.47 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  26.5 
 
 		 152 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  24.83 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  28.47 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  23.44 
 
 		 270 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  23.44 
 
 		 270 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  23.44 
 
 		 270 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  23.44 
 
 		 270 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  26.85 
 
 		 229 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  26.62 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  23.44 
 
 		 270 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  22.44 
 
 		 159 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  23.44 
 
 		 270 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  32.37 
 
 		 163 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  30.83 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  23.44 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0285  hypothetical protein  30.52 
 
 		 149 aa  50.1  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.315039  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 160 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  25.63 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  30.4 
 
 		 127 aa  49.3  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  21.88 
 
 		 270 aa  48.9  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  31.58 
 
 		 152 aa  48.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  27.52 
 
 		 225 aa  48.5  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  31.82 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  33.82 
 
 		 137 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  22.66 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  31.11 
 
 		 178 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  22.66 
 
 		 270 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  40.86 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  30.52 
 
 		 162 aa  46.6  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  23.57 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  25.4 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  29.14 
 
 		 168 aa  45.4  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  23.44 
 
 		 270 aa  45.1  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 152 aa  45.4  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  32 
 
 		 152 aa  45.1  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1020  regulatory protein RecX  32.1 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  29.08 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  27.89 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  30.59 
 
 		 151 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  32.29 
 
 		 159 aa  42.7  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  25.19 
 
 		 271 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  26.24 
 
 		 165 aa  42.4  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 214 aa  42  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  25.97 
 
 		 163 aa  41.6  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  27.34 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  25.68 
 
 		 152 aa  41.6  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>