86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23190 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  417  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  53.05 
 
 		 201 aa  128  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  54.9 
 
 		 216 aa  125  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  42.77 
 
 		 357 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  45.57 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  53.69 
 
 		 186 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  49.66 
 
 		 176 aa  109  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  41.98 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  40 
 
 		 194 aa  105  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  40.22 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  47.76 
 
 		 137 aa  102  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  40 
 
 		 202 aa  101  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  40.99 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  42 
 
 		 163 aa  99  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  40 
 
 		 192 aa  98.2  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  37.67 
 
 		 179 aa  97.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  38.71 
 
 		 220 aa  95.5  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  34.52 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  39.16 
 
 		 183 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  39.16 
 
 		 183 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  38.55 
 
 		 183 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  38.37 
 
 		 170 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  38 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  38.12 
 
 		 191 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  37.95 
 
 		 229 aa  89  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  38.26 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  38.12 
 
 		 184 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  36.59 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  35.93 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  38.71 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  38.36 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  35 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  37.93 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  42.86 
 
 		 127 aa  74.3  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  37.96 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0285  hypothetical protein  38.81 
 
 		 149 aa  70.9  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.315039  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  30.63 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  33.79 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  35.9 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  31.94 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  40 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  37.58 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  24.16 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  35.46 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10730  hypothetical protein  32.75 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0103312  unclonable  0.00000000098721 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  28.17 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  23.42 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  24.66 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  24.84 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  25.79 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  38.54 
 
 		 161 aa  54.7  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  32 
 
 		 167 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  40.23 
 
 		 152 aa  52.8  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  27.13 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  26.57 
 
 		 152 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1020  regulatory protein RecX  35.14 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  27.27 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  32.26 
 
 		 149 aa  48.9  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0020  regulatory protein RecX  32.71 
 
 		 150 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  27.03 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  24.53 
 
 		 270 aa  46.6  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  25.32 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  26.8 
 
 		 160 aa  45.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  25.89 
 
 		 156 aa  45.4  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0873  regulatory protein RecX  29.01 
 
 		 158 aa  45.1  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0639  regulatory protein RecX  38.94 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  23.6 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  32.71 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  26.92 
 
 		 271 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  25.74 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2040  recombination regulator RecX  30.83 
 
 		 297 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  23.6 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0441  regulatory protein RecX  31.52 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  31.43 
 
 		 163 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1618  regulatory protein RecX  42.86 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000117054  hitchhiker  0.000000000911842 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  24.84 
 
 		 270 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2651  recombination regulator RecX  30.83 
 
 		 297 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  30.67 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0422  recombination regulator RecX  21.85 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  24.03 
 
 		 270 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  27.7 
 
 		 152 aa  42.4  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2572  recombination regulator RecX  32.65 
 
 		 293 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  29.17 
 
 		 163 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  30.92 
 
 		 179 aa  41.6  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>