87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1243 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  100 
 
 		 216 aa  410  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  56.52 
 
 		 201 aa  154  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  52.9 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  54.9 
 
 		 217 aa  145  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  50.65 
 
 		 163 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  45.5 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  49.67 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  47.56 
 
 		 185 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  44.79 
 
 		 357 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  55.7 
 
 		 186 aa  131  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  43.72 
 
 		 226 aa  131  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  47.22 
 
 		 220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  46.41 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  50.68 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  45.34 
 
 		 179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  45.39 
 
 		 192 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  45.51 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  46.88 
 
 		 338 aa  119  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  45.24 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  46.2 
 
 		 167 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  42.41 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  42 
 
 		 160 aa  105  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  44.23 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  43.59 
 
 		 183 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  42.21 
 
 		 198 aa  99  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  43.59 
 
 		 183 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  41.77 
 
 		 191 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  42.95 
 
 		 174 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  45.14 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  44.03 
 
 		 137 aa  89.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  41.56 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  39.35 
 
 		 202 aa  85.1  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0285  hypothetical protein  41.73 
 
 		 149 aa  83.6  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.315039  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  42.58 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  37.5 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  43.64 
 
 		 127 aa  74.3  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  32.08 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  30.32 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  30.28 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  26.92 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  36.67 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  29.63 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1020  regulatory protein RecX  36.13 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  27.27 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  26.21 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  43.01 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  31.76 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  26.9 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  27.78 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  24.32 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  28.83 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  25.52 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  30.41 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  36.76 
 
 		 152 aa  52.8  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  30 
 
 		 178 aa  52.8  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  22.56 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  26.52 
 
 		 160 aa  52  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  27.27 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  23.78 
 
 		 267 aa  49.7  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  28.28 
 
 		 152 aa  49.3  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  28.72 
 
 		 153 aa  48.5  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  28.78 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  31.17 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  21.92 
 
 		 152 aa  48.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  32.76 
 
 		 152 aa  47.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1618  regulatory protein RecX  43.94 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000117054  hitchhiker  0.000000000911842 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  36.81 
 
 		 149 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  24.18 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  28.12 
 
 		 129 aa  47.8  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  27.34 
 
 		 165 aa  47.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  33.67 
 
 		 150 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  29.89 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  32.43 
 
 		 164 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  26.52 
 
 		 151 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  30.83 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  32.14 
 
 		 168 aa  45.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  25.56 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  30.26 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  31.94 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  32 
 
 		 153 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07470  hypothetical protein  27.01 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0298056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  32.08 
 
 		 160 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  28.15 
 
 		 150 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  26.14 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  28.47 
 
 		 152 aa  42  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  30.56 
 
 		 156 aa  41.6  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  29.93 
 
 		 185 aa  41.6  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>