100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0457 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  100 
 
 
271 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  58.4 
 
 
269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  45.25 
 
 
270 aa  217  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  46.3 
 
 
270 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  44.87 
 
 
270 aa  206  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  45.25 
 
 
270 aa  206  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  44.49 
 
 
270 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  44.11 
 
 
270 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  44.11 
 
 
270 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  44.11 
 
 
270 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  44.11 
 
 
270 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  44.11 
 
 
270 aa  202  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  44.11 
 
 
270 aa  202  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  36.09 
 
 
264 aa  140  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  34.94 
 
 
267 aa  137  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  30.74 
 
 
271 aa  126  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  31.44 
 
 
271 aa  101  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1927  recombination regulator RecX  32.52 
 
 
272 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1411  recombination regulator RecX  30.04 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1961  recombination regulator RecX  32.52 
 
 
272 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0412  recombination regulator RecX  26.91 
 
 
258 aa  94  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  30.77 
 
 
269 aa  92  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  28.77 
 
 
253 aa  89  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  28.71 
 
 
221 aa  86.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  30.97 
 
 
228 aa  85.5  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  28.23 
 
 
210 aa  79  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  26.24 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  27.88 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  28.16 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  26.19 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  27.18 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  32.7 
 
 
156 aa  71.2  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0422  recombination regulator RecX  25.32 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  34.59 
 
 
129 aa  67.8  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  31.91 
 
 
152 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  25.25 
 
 
229 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  35.21 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  26.67 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  27.97 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  30.95 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  31.72 
 
 
161 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2972  regulatory protein RecX  31.52 
 
 
184 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.439086  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  34.81 
 
 
152 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  27.18 
 
 
206 aa  63.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  29.79 
 
 
199 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  26.67 
 
 
212 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  31.03 
 
 
161 aa  62.8  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  24.35 
 
 
201 aa  57.4  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  29.2 
 
 
159 aa  56.2  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  27.92 
 
 
163 aa  56.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  26.54 
 
 
195 aa  55.8  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  34.91 
 
 
184 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  26.09 
 
 
167 aa  53.1  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  27.97 
 
 
153 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1119  regulatory protein RecX  26.94 
 
 
188 aa  52.4  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  28.68 
 
 
183 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  32.26 
 
 
151 aa  52.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  27.94 
 
 
183 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  27.94 
 
 
183 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  31.13 
 
 
198 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  27.03 
 
 
202 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  27.82 
 
 
137 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  31.25 
 
 
150 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  31.94 
 
 
150 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  26.92 
 
 
254 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  30.21 
 
 
191 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  26.9 
 
 
151 aa  50.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  30.84 
 
 
178 aa  49.7  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  25.83 
 
 
179 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  26.17 
 
 
155 aa  49.3  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  30.28 
 
 
156 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  27.08 
 
 
153 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  26 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  25.97 
 
 
179 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  32.38 
 
 
149 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  27.89 
 
 
186 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  28.87 
 
 
156 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  25.17 
 
 
163 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  24.02 
 
 
220 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  25.38 
 
 
160 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  28.87 
 
 
156 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  23.24 
 
 
222 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  25.68 
 
 
174 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  23.53 
 
 
257 aa  45.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  27.63 
 
 
155 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  36.11 
 
 
152 aa  45.8  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  27.39 
 
 
164 aa  45.8  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  27.14 
 
 
150 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  25.81 
 
 
202 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  27.39 
 
 
156 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  30.88 
 
 
217 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10730  hypothetical protein  29.2 
 
 
177 aa  43.9  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0103312  unclonable  0.00000000098721 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  35.63 
 
 
160 aa  43.9  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  24.83 
 
 
204 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  26.92 
 
 
217 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  27.08 
 
 
149 aa  43.5  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  28.03 
 
 
161 aa  43.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2438  regulatory protein RecX  26.97 
 
 
213 aa  43.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000098324  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  25 
 
 
223 aa  42.7  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5194  regulatory protein RecX  28.57 
 
 
150 aa  42  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.910753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>