48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1961 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1961  recombination regulator RecX  100 
 
 		 272 aa  541  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1927  recombination regulator RecX  100 
 
 		 272 aa  541  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1411  recombination regulator RecX  72.18 
 
 		 267 aa  392  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0412  recombination regulator RecX  37.93 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0422  recombination regulator RecX  32.32 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  31.68 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  35.1 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  30.37 
 
 		 270 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  30.19 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  29.81 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  30.74 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  28.89 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  28.68 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  32.52 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  29.63 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  28.57 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  28.15 
 
 		 270 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  28.15 
 
 		 270 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  28.15 
 
 		 270 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  28.15 
 
 		 270 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  28.15 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  28.15 
 
 		 270 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  26.3 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  28.85 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  27.27 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  22.97 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  26.57 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  25.96 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  27.09 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  25.68 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  20.87 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  21.57 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  22.71 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  22.71 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  25.22 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  25.97 
 
 		 152 aa  52.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 156 aa  51.6  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2972  regulatory protein RecX  28.72 
 
 		 184 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.439086  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  22.86 
 
 		 167 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  26.9 
 
 		 151 aa  50.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  24.43 
 
 		 201 aa  48.9  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  25.17 
 
 		 151 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  22.15 
 
 		 229 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  26 
 
 		 152 aa  46.6  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  25.17 
 
 		 161 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  25.17 
 
 		 161 aa  44.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  25.69 
 
 		 151 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  24.27 
 
 		 217 aa  42.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>