128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1746 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  100 
 
 
221 aa  435  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  48.58 
 
 
227 aa  190  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  50 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  42.99 
 
 
228 aa  169  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  38.57 
 
 
253 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  34.39 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  31.58 
 
 
210 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  33.02 
 
 
214 aa  111  9e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  31.92 
 
 
214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  36.97 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  28.71 
 
 
271 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  27.05 
 
 
206 aa  85.1  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  39.58 
 
 
174 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  41.84 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  38.46 
 
 
167 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  39.72 
 
 
183 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  39.72 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  39.72 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  39.44 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  33.11 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  38.89 
 
 
191 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  37.84 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  30.67 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  26.19 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  39.86 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  36.6 
 
 
152 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  35.37 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  25.71 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  34.69 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  39.01 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  26.67 
 
 
267 aa  72  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  22.07 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  24.66 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  34.53 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  36.11 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  35.9 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  33.87 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  28 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  42.57 
 
 
186 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  27.14 
 
 
269 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  32.86 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  34.27 
 
 
185 aa  63.2  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  22.64 
 
 
270 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  37.59 
 
 
153 aa  62.8  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1927  recombination regulator RecX  25.68 
 
 
272 aa  62.8  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1961  recombination regulator RecX  25.68 
 
 
272 aa  62.8  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  36.36 
 
 
254 aa  62.8  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  22.54 
 
 
270 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  22.54 
 
 
270 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  22.54 
 
 
270 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  22.54 
 
 
270 aa  62  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  22.54 
 
 
270 aa  62  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  25 
 
 
271 aa  62.4  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  33.55 
 
 
201 aa  62.4  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  22.54 
 
 
270 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  32.11 
 
 
207 aa  62  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  22.07 
 
 
270 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  35.25 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  27.44 
 
 
152 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  36.72 
 
 
198 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  25.53 
 
 
264 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  29.25 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  34.69 
 
 
179 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  23 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0412  recombination regulator RecX  21.78 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  30.88 
 
 
129 aa  60.1  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  23 
 
 
270 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  26.49 
 
 
159 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  33.58 
 
 
163 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  34.71 
 
 
168 aa  59.3  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  33.09 
 
 
223 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  32.31 
 
 
165 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1411  recombination regulator RecX  21.26 
 
 
267 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  29.37 
 
 
156 aa  58.2  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  33.77 
 
 
160 aa  57.8  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  30.22 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  32.91 
 
 
154 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  35.04 
 
 
202 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  33.11 
 
 
154 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3016  regulatory protein RecX  28.36 
 
 
155 aa  55.5  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  32.87 
 
 
156 aa  55.5  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  31.68 
 
 
160 aa  55.1  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1020  regulatory protein RecX  34.62 
 
 
222 aa  55.1  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  29.73 
 
 
150 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  34.31 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  31.58 
 
 
151 aa  54.3  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  34.31 
 
 
195 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2972  regulatory protein RecX  26.53 
 
 
184 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.439086  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  34.21 
 
 
176 aa  53.9  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  38.21 
 
 
167 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  42.53 
 
 
152 aa  53.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  29.93 
 
 
161 aa  53.5  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  36.17 
 
 
149 aa  53.5  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  29.3 
 
 
178 aa  53.1  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2438  regulatory protein RecX  25.62 
 
 
213 aa  52  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000098324  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  29.25 
 
 
161 aa  52  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  29.3 
 
 
159 aa  52.4  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  32.24 
 
 
338 aa  52.4  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  34.21 
 
 
152 aa  51.6  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  31.58 
 
 
150 aa  51.2  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>