100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1390 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  100 
 
 		 226 aa  424  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  87.61 
 
 		 220 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  55.74 
 
 		 192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  58.08 
 
 		 220 aa  174  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  60.53 
 
 		 185 aa  158  8e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  56.44 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  57.24 
 
 		 163 aa  155  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  50.48 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  53.05 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  46.2 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  48.55 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  53.9 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  49.37 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  43.43 
 
 		 216 aa  128  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  46.99 
 
 		 338 aa  128  8.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  45.22 
 
 		 179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  46.62 
 
 		 357 aa  126  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  48.75 
 
 		 186 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  44.03 
 
 		 160 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  44.83 
 
 		 191 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  52.32 
 
 		 167 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  48.45 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  45.96 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  50.99 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  45.16 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  43.75 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  43.75 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  43.12 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  43.12 
 
 		 174 aa  102  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  48.91 
 
 		 137 aa  99.8  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  41.18 
 
 		 170 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  38.61 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  42.07 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  41.84 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  34.46 
 
 		 253 aa  81.6  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  36 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  39.53 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  35.33 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  44.55 
 
 		 127 aa  78.2  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  41.88 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  41.04 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  28.03 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  28.66 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  28.48 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  38.46 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  27.34 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  36.11 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  38.19 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  39.32 
 
 		 153 aa  61.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  29.77 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  28.17 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  35.17 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  36.23 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  29.08 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  27.69 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  38.89 
 
 		 149 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  23.13 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  39.16 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  34.48 
 
 		 159 aa  54.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  40 
 
 		 161 aa  54.3  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  33.1 
 
 		 152 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  29.32 
 
 		 153 aa  52.8  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1618  regulatory protein RecX  37.5 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000117054  hitchhiker  0.000000000911842 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  38.35 
 
 		 162 aa  51.2  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  32.58 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  36.36 
 
 		 163 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  25.58 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  41.18 
 
 		 155 aa  49.7  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  31.37 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 151 aa  49.3  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  25.58 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  31.18 
 
 		 160 aa  48.5  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  27.48 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  36.24 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  27.56 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  30.53 
 
 		 179 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2407  putative regulatory protein RecX  27.52 
 
 		 171 aa  46.2  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.457695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  34.35 
 
 		 154 aa  46.2  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  24.11 
 
 		 267 aa  45.8  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  24.26 
 
 		 152 aa  45.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  37.11 
 
 		 150 aa  45.8  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  25.23 
 
 		 271 aa  45.4  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  41.1 
 
 		 137 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  29.24 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  29.52 
 
 		 164 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  31.71 
 
 		 163 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  31.17 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  41.25 
 
 		 152 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  35.71 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  26.72 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  41.25 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  20.45 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10730  hypothetical protein  30.13 
 
 		 177 aa  42.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0103312  unclonable  0.00000000098721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  24.03 
 
 		 151 aa  42.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1022  regulatory protein RecX  28.26 
 
 		 153 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0285  hypothetical protein  31.97 
 
 		 149 aa  42.7  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.315039  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  36.67 
 
 		 156 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  26.56 
 
 		 155 aa  42  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0388  recX protein  40.26 
 
 		 138 aa  42  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>