62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1474 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  100 
 
 
217 aa  421  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  37.75 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  33.87 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  38.03 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  34.72 
 
 
167 aa  62.4  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  32.37 
 
 
253 aa  62.4  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  34.23 
 
 
194 aa  62  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  24.42 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  26.23 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  37.58 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  34.59 
 
 
227 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  27.59 
 
 
214 aa  58.5  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  35.21 
 
 
226 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  30.38 
 
 
228 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  36.73 
 
 
216 aa  55.1  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  27.59 
 
 
152 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  35.62 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  25.71 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  32.89 
 
 
170 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  31.72 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  32.68 
 
 
179 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  33.33 
 
 
163 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  31.89 
 
 
269 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  36.02 
 
 
183 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  35.37 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  28.78 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  25.15 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  28.48 
 
 
161 aa  49.7  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  27.81 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  32.43 
 
 
160 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  34.78 
 
 
183 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  34.78 
 
 
183 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  30.6 
 
 
222 aa  48.9  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  29.2 
 
 
156 aa  48.9  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  27.22 
 
 
156 aa  48.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  30.12 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  30.77 
 
 
185 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  30.99 
 
 
198 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  29.81 
 
 
184 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  33.8 
 
 
199 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  27.13 
 
 
198 aa  45.4  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  34.18 
 
 
179 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  28.36 
 
 
154 aa  45.1  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  26.8 
 
 
161 aa  45.1  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  31.13 
 
 
168 aa  45.1  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  36.26 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  24.82 
 
 
129 aa  44.3  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4386  hypothetical protein  42.47 
 
 
105 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.684002  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  30.88 
 
 
271 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  31.65 
 
 
191 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  34.51 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2438  regulatory protein RecX  24.87 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000098324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  29.8 
 
 
152 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  32.68 
 
 
167 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  30 
 
 
205 aa  42.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  21.03 
 
 
206 aa  43.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  35.87 
 
 
153 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  20.62 
 
 
271 aa  42.4  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  33.12 
 
 
152 aa  41.6  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  27.27 
 
 
264 aa  42  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  35.82 
 
 
150 aa  41.6  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  33.57 
 
 
155 aa  41.6  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>