92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2342 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  100 
 
 		 202 aa  388  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  58.62 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  52.69 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  51.81 
 
 		 220 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  52.47 
 
 		 201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  53.7 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  52.12 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  48.86 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  50.63 
 
 		 192 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  52.67 
 
 		 163 aa  142  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  53.8 
 
 		 338 aa  142  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  48.75 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  55.7 
 
 		 167 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  45.55 
 
 		 223 aa  135  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  46.93 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  46.71 
 
 		 357 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  52.12 
 
 		 186 aa  132  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  52.08 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  54.55 
 
 		 137 aa  119  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  49.02 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  52.14 
 
 		 199 aa  118  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  47.5 
 
 		 160 aa  117  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  43.79 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  47.71 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  46.41 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  46.88 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  45.4 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  46.25 
 
 		 183 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  46.25 
 
 		 183 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  48.34 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  40 
 
 		 217 aa  101  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  46.36 
 
 		 127 aa  92.4  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  42.86 
 
 		 257 aa  91.7  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  37.71 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  36 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  37.32 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  39.53 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  36.62 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  36.92 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  40.82 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  31.13 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  29.41 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  28.67 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  33.6 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  27.48 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  34.23 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  32 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  27.48 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  35.25 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  32.88 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  31.71 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  29.03 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  25.66 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  32.61 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  31.94 
 
 		 159 aa  54.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  30.71 
 
 		 160 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  24.63 
 
 		 159 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  36.51 
 
 		 156 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  32.46 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  28.15 
 
 		 163 aa  52.4  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  27.89 
 
 		 165 aa  52.4  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  40.38 
 
 		 153 aa  52  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  20.77 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  28.76 
 
 		 156 aa  52  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  35.71 
 
 		 154 aa  51.6  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  35.63 
 
 		 149 aa  51.6  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  28.93 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  22.05 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3614  regulatory protein RecX  36.28 
 
 		 177 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0968404  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  37.89 
 
 		 152 aa  48.9  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  24.81 
 
 		 151 aa  48.9  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  36.84 
 
 		 152 aa  48.5  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  40.74 
 
 		 151 aa  48.1  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  26.28 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  32.84 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  30.2 
 
 		 155 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1167  hypothetical protein  22.64 
 
 		 160 aa  46.2  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.254719 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  35.29 
 
 		 161 aa  46.6  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  29.58 
 
 		 152 aa  45.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  33.07 
 
 		 163 aa  45.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  24.34 
 
 		 164 aa  45.1  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  25.81 
 
 		 271 aa  45.1  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  33.63 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  32.06 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3293  regulatory protein RecX  25.93 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5978  recombination regulator RecX  31.88 
 
 		 289 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.129399 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0651  recombination regulator RecX  31.88 
 
 		 285 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  26.95 
 
 		 163 aa  42.4  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  27.27 
 
 		 153 aa  42.4  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  27.97 
 
 		 269 aa  42  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  22.38 
 
 		 267 aa  41.6  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1119  regulatory protein RecX  23.02 
 
 		 188 aa  41.6  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>