78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1582 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  100 
 
 		 357 aa  694    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  51.92 
 
 		 254 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  51.53 
 
 		 185 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  54.09 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  54.14 
 
 		 163 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  48.8 
 
 		 201 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  49.69 
 
 		 222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  46.71 
 
 		 202 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  46.25 
 
 		 338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  42.77 
 
 		 217 aa  123  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  49.67 
 
 		 186 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  43.56 
 
 		 192 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  46.48 
 
 		 220 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  45.89 
 
 		 205 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  45.77 
 
 		 226 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  43.62 
 
 		 223 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  39.63 
 
 		 194 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  39.41 
 
 		 179 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  49.24 
 
 		 137 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  44.79 
 
 		 216 aa  113  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  44.58 
 
 		 160 aa  113  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  42.86 
 
 		 199 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  43.1 
 
 		 184 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  42.18 
 
 		 202 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  44.65 
 
 		 167 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  40.38 
 
 		 191 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  41.03 
 
 		 183 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  41.03 
 
 		 183 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  40.38 
 
 		 183 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  38.71 
 
 		 174 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  36.46 
 
 		 198 aa  86.7  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  37.24 
 
 		 170 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  40.17 
 
 		 127 aa  74.7  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  33.59 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  32.62 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  35.48 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  31.03 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  29.23 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  29.41 
 
 		 228 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  29.01 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  25.87 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  34.11 
 
 		 137 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  27.2 
 
 		 206 aa  53.1  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  25.17 
 
 		 152 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  28.92 
 
 		 198 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  29.3 
 
 		 164 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  24.83 
 
 		 212 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  25.18 
 
 		 264 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  25.87 
 
 		 270 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  29.2 
 
 		 221 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  25.87 
 
 		 270 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  24.83 
 
 		 212 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  25.87 
 
 		 270 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  25.87 
 
 		 270 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  25.87 
 
 		 270 aa  50.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  25.87 
 
 		 270 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  29.85 
 
 		 159 aa  50.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  30.97 
 
 		 225 aa  50.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  25.87 
 
 		 270 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  25.87 
 
 		 270 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  25.87 
 
 		 270 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  29.55 
 
 		 195 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  37.86 
 
 		 149 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  21.32 
 
 		 163 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  27.21 
 
 		 270 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2438  regulatory protein RecX  28.97 
 
 		 213 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000098324  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  26.28 
 
 		 151 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  31.2 
 
 		 178 aa  47.4  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  24.32 
 
 		 201 aa  47.4  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  26.52 
 
 		 151 aa  46.6  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  34.57 
 
 		 149 aa  46.2  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 204 aa  46.2  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  31.75 
 
 		 152 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  23.84 
 
 		 214 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  21.29 
 
 		 267 aa  43.9  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  30.83 
 
 		 224 aa  43.5  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1548  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 172 aa  43.1  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  27.14 
 
 		 269 aa  42.7  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>