113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5048 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  100 
 
 		 151 aa  310  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3293  regulatory protein RecX  56.94 
 
 		 150 aa  173  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  51.05 
 
 		 163 aa  147  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3722  regulatory protein RecX  46.81 
 
 		 161 aa  140  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.658929  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1022  regulatory protein RecX  47.22 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02685  putative transcriptional regulatory protein  40.82 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392987  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1030  regulatory protein RecX  38.93 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0807  regulatory protein RecX  36.73 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1167  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.254719 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  32.35 
 
 		 201 aa  67.4  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  26.92 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0157  regulatory protein RecX  26.87 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  30.71 
 
 		 210 aa  60.8  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  28.19 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  32.31 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  28.19 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  32.31 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  26.52 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  27.52 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  27.52 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  27.52 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  27.52 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  27.52 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  27.52 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  25 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  26.92 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  27.52 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  27.52 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  27.52 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  24.83 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  29.55 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  30.82 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  23.94 
 
 		 267 aa  54.3  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  30.82 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  30.82 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  28.43 
 
 		 271 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  30.14 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  30.82 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  23.97 
 
 		 271 aa  52.4  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  30.94 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  24.46 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  28.29 
 
 		 220 aa  51.6  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  29.71 
 
 		 156 aa  51.2  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  25.78 
 
 		 217 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  27.7 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  28.97 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  27.78 
 
 		 179 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  28.97 
 
 		 166 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  28.97 
 
 		 166 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  28.97 
 
 		 166 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  28.97 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  28.97 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  28.97 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  28.97 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  28.97 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  22.6 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0412  recombination regulator RecX  25.19 
 
 		 258 aa  49.7  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  27.56 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  24.81 
 
 		 202 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  28.87 
 
 		 253 aa  48.5  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  27.27 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  31.87 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07470  hypothetical protein  27.33 
 
 		 233 aa  48.1  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0298056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  27.96 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 166 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  27.81 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  21.23 
 
 		 214 aa  47  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  23.91 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  26.52 
 
 		 357 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  25 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  27 
 
 		 264 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  29.7 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  26.39 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  43.48 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  30.53 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  26.57 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  26.85 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  26.85 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  27.92 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1927  recombination regulator RecX  25.69 
 
 		 272 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  26.57 
 
 		 156 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  23.66 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1961  recombination regulator RecX  25.69 
 
 		 272 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  28.89 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  24 
 
 		 179 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  22.52 
 
 		 192 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  31.82 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  27.37 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  27.78 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  29.47 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  26.57 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  24.24 
 
 		 220 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  24.73 
 
 		 150 aa  42.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  26.03 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  24.83 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  21.9 
 
 		 214 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  26.67 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  28.71 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  21.9 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  24.03 
 
 		 226 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>