50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_07470 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_07470  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  480  1e-135  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0298056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1618  regulatory protein RecX  41.43 
 
 		 225 aa  99.4  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000117054  hitchhiker  0.000000000911842 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10730  hypothetical protein  35.53 
 
 		 177 aa  93.6  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0103312  unclonable  0.00000000098721 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  35 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  29.05 
 
 		 150 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  37.93 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  37.93 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  28.38 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  27.45 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  28.97 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  29.5 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  41.54 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  27.78 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  29.25 
 
 		 154 aa  55.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  31.01 
 
 		 198 aa  53.1  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  36.11 
 
 		 152 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  38.46 
 
 		 156 aa  52  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  32 
 
 		 156 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3016  regulatory protein RecX  32.91 
 
 		 155 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  34.53 
 
 		 152 aa  50.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  33.75 
 
 		 149 aa  49.3  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2407  putative regulatory protein RecX  40.58 
 
 		 171 aa  48.9  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.457695  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  27.95 
 
 		 179 aa  48.9  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  30.15 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  32.61 
 
 		 150 aa  48.9  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  25.16 
 
 		 217 aa  48.5  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  27.33 
 
 		 151 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  39.13 
 
 		 183 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  39.13 
 
 		 183 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  39.13 
 
 		 183 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2746  regulatory protein RecX  26.67 
 
 		 137 aa  46.2  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  29.41 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  25.19 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  28.91 
 
 		 145 aa  45.4  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  34.21 
 
 		 144 aa  45.4  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  25.37 
 
 		 212 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3268  regulatory protein RecX  26.67 
 
 		 137 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  34.21 
 
 		 144 aa  45.4  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  29.63 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3125  regulatory protein RecX  26.23 
 
 		 137 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  28.91 
 
 		 152 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3116  regulatory protein RecX  26.67 
 
 		 137 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  32.76 
 
 		 152 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  37.5 
 
 		 167 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  27.45 
 
 		 163 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  32.47 
 
 		 161 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  27.4 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  33.68 
 
 		 191 aa  42.4  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  27.21 
 
 		 156 aa  42  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  40.35 
 
 		 253 aa  41.6  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>