110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27810 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  348  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  59.12 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  52.69 
 
 		 202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  51.88 
 
 		 163 aa  154  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  47.56 
 
 		 185 aa  144  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  49.07 
 
 		 254 aa  137  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  47.06 
 
 		 192 aa  134  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  47.17 
 
 		 222 aa  134  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  44.71 
 
 		 220 aa  134  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  44.12 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  44.57 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  50.35 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  45.03 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  47.83 
 
 		 338 aa  123  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  44.51 
 
 		 205 aa  123  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  50.71 
 
 		 199 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  45.77 
 
 		 226 aa  121  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  44.57 
 
 		 191 aa  120  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  42.01 
 
 		 198 aa  117  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  42.86 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  45.73 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  45.73 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  45.73 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  45.34 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  39.41 
 
 		 357 aa  114  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  46.81 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  44.08 
 
 		 202 aa  111  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  41.94 
 
 		 223 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  41.07 
 
 		 170 aa  107  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  40.94 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  37.67 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  43.53 
 
 		 257 aa  95.9  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  39.57 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  32.39 
 
 		 227 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  44.36 
 
 		 137 aa  89.4  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  35.71 
 
 		 253 aa  88.2  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  40.74 
 
 		 228 aa  86.3  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  43.64 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  37.23 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  38.76 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  34.27 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  34.72 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  29.81 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  27.95 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  30.82 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  29.81 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  35.37 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  36.42 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  35.33 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  26.67 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  28.86 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  34.81 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  37.32 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0285  hypothetical protein  33.58 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.315039  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  26.8 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  30 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  29.55 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  23.57 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  26.57 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  34.46 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  29.45 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  30.56 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  32.68 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  34.38 
 
 		 163 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1618  regulatory protein RecX  40.23 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000117054  hitchhiker  0.000000000911842 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  27.89 
 
 		 151 aa  52.4  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  23.24 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  29.79 
 
 		 156 aa  51.2  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  31.34 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  31.2 
 
 		 129 aa  50.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07470  hypothetical protein  27.95 
 
 		 233 aa  49.7  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0298056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  30.43 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  27.16 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  27.52 
 
 		 152 aa  48.1  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  25.97 
 
 		 271 aa  48.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  29.32 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  30.87 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1020  regulatory protein RecX  34.58 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  31.91 
 
 		 148 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3722  regulatory protein RecX  20.89 
 
 		 161 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.658929  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  23.08 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  30.63 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  25.81 
 
 		 270 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  30.94 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  31.85 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  34.69 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  29.58 
 
 		 152 aa  45.1  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  24 
 
 		 151 aa  44.7  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  30.09 
 
 		 159 aa  44.7  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  32.14 
 
 		 150 aa  44.7  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  34.69 
 
 		 161 aa  44.7  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2407  putative regulatory protein RecX  28.85 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.457695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  30.66 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2558  hypothetical protein  29.94 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.173611 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2438  regulatory protein RecX  25 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000098324  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  40.23 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  25 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  19.62 
 
 		 267 aa  43.5  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>