153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3974 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  100 
 
 		 191 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  83.42 
 
 		 184 aa  300  7.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  71.28 
 
 		 183 aa  241  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  71.81 
 
 		 183 aa  240  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  71.81 
 
 		 183 aa  240  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  63.83 
 
 		 174 aa  207  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  49.69 
 
 		 192 aa  133  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  47.4 
 
 		 170 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  44.57 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  46.01 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  46.55 
 
 		 185 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  45.75 
 
 		 198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  43.53 
 
 		 220 aa  117  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  47.71 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  46.34 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  44.81 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  43.33 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  45.4 
 
 		 338 aa  111  6e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  43.82 
 
 		 222 aa  111  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  43.87 
 
 		 254 aa  110  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  50.32 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  45.45 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  45.75 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  43.04 
 
 		 223 aa  104  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  44.87 
 
 		 186 aa  101  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  40.36 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  38.73 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  40.38 
 
 		 357 aa  97.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  41.06 
 
 		 160 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  45.67 
 
 		 257 aa  92.8  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  38.12 
 
 		 217 aa  89.4  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  45.71 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  35.22 
 
 		 253 aa  80.9  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  35.17 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  36.67 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  38.89 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  35.71 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  43.48 
 
 		 137 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  38.26 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  38.41 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  31.88 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  36.56 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  40.21 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  37.76 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  34.53 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  39.58 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  38.14 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  40.56 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  29.22 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  28.39 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26893  predicted protein  31.15 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.975242  normal  0.41218 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  34.41 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  29.14 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  36.81 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  36.57 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  36.57 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  30.81 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  34.07 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  31.79 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  33.01 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  24.64 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  28.86 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  28.75 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  28.99 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  37.78 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  27.69 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  33.11 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  39.8 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  35.44 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  33.81 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  32.14 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  33.79 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  32.62 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  34.33 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1509  regulatory protein RecX  43.68 
 
 		 151 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99842  normal  0.151917 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 129 aa  53.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  26.58 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  32.56 
 
 		 156 aa  52.4  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1618  regulatory protein RecX  37.97 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000117054  hitchhiker  0.000000000911842 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  33.72 
 
 		 149 aa  51.6  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  24.44 
 
 		 269 aa  50.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  24.34 
 
 		 164 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  28.33 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2438  regulatory protein RecX  26.45 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000098324  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02685  putative transcriptional regulatory protein  26.92 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392987  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  30.99 
 
 		 168 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  26.58 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  23.64 
 
 		 267 aa  49.7  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  30.21 
 
 		 271 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  33.83 
 
 		 156 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  26.8 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  33.83 
 
 		 137 aa  48.9  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2558  hypothetical protein  32.45 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.173611 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  27.54 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  32.53 
 
 		 150 aa  48.5  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  35.23 
 
 		 151 aa  48.5  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  39.76 
 
 		 150 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  34.52 
 
 		 144 aa  47.8  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  34.52 
 
 		 144 aa  47.8  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  32.22 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>