128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3125 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3125  regulatory protein RecX  100 
 
 		 137 aa  283  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3268  regulatory protein RecX  99.27 
 
 		 137 aa  282  9e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2746  regulatory protein RecX  94.12 
 
 		 137 aa  267  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3116  regulatory protein RecX  97.62 
 
 		 137 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  97.62 
 
 		 163 aa  256  6e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  75.74 
 
 		 152 aa  202  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3429  regulatory protein RecX  74.02 
 
 		 127 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1127  regulatory protein RecX  73.98 
 
 		 123 aa  179  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1126  regulatory protein RecX  73.98 
 
 		 123 aa  177  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  50.39 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  44.78 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  44.19 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  43.41 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  36.8 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1591  regulatory protein RecX  38.46 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  35.96 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  35.96 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  36.28 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  34.15 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  35.96 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  35.96 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  36.28 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  35.96 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  35.96 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  36.28 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  35.71 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  34.21 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  33.04 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  31.4 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  36.61 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  36.61 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  32.46 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  32.46 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  32.46 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  32.58 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  32.46 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  31.58 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  27.05 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  33.6 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  30.83 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  30.08 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  30.97 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  32 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  31.58 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  32 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  34.82 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  30.58 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  30.23 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  27.97 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  32.79 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  32.79 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  31.67 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3016  regulatory protein RecX  37.89 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  30.4 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  32.76 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  34.82 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  34.82 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  32 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  27.14 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1051  regulatory protein RecX  31.25 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0599786 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0933  regulatory protein RecX  31.25 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  29.37 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  31.4 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  28.79 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  30.89 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  27.69 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1733  inhibitor/regulator of recA, recX  29.68 
 
 		 373 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.122628  normal  0.0971818 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0388  recX protein  35 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  28 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  27.34 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2669  regulatory protein recX  32.43 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  29.75 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  29.92 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  28.8 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  27.27 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2015  putative inhibitor/regulator of RecA, RecX  29.41 
 
 		 373 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.310936 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  29.41 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2680  recombination regulator RecX  33.61 
 
 		 302 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.521249  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0273  recombination regulator RecX  30 
 
 		 327 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0973  recombination regulator RecX  30 
 
 		 327 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2040  recombination regulator RecX  33.61 
 
 		 297 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2651  recombination regulator RecX  33.61 
 
 		 297 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2673  recombination regulator RecX  30 
 
 		 327 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2403  recombination regulator RecX  30 
 
 		 327 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0016  recombination regulator RecX  30 
 
 		 327 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  31.31 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0811  recombination regulator RecX  30 
 
 		 327 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0815  recombination regulator RecX  30 
 
 		 327 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0528  recombination regulator RecX  25.95 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00754387  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2572  recombination regulator RecX  32.58 
 
 		 293 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  32.26 
 
 		 269 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0644  recombination regulator RecX  30 
 
 		 325 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490193  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  26.61 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2698  recombination regulator RecX  32.58 
 
 		 293 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  34.38 
 
 		 198 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5978  recombination regulator RecX  31.97 
 
 		 289 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.129399 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  28.91 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  27.35 
 
 		 224 aa  47.8  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0873  regulatory protein RecX  27.34 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473072 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>