40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0807 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0807  regulatory protein RecX  100 
 
 
156 aa  319  7e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1030  regulatory protein RecX  52.9 
 
 
159 aa  155  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02685  putative transcriptional regulatory protein  53.02 
 
 
159 aa  149  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392987  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  44.44 
 
 
163 aa  130  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1022  regulatory protein RecX  42.36 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3722  regulatory protein RecX  41.89 
 
 
161 aa  120  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.658929  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  36.73 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1167  hypothetical protein  39.19 
 
 
160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.254719 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3293  regulatory protein RecX  39.31 
 
 
150 aa  108  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0157  regulatory protein RecX  30.97 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  24.31 
 
 
271 aa  58.2  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  24.14 
 
 
170 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  31.11 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  26.35 
 
 
225 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  26.83 
 
 
150 aa  48.5  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  20.74 
 
 
179 aa  48.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  23.36 
 
 
163 aa  47.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  23.23 
 
 
264 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  27.41 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  26.57 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  26.67 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  22.3 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  29.29 
 
 
271 aa  44.3  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  20.77 
 
 
270 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  26.6 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  20 
 
 
270 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  27.45 
 
 
210 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  16.79 
 
 
163 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  25.56 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  19.82 
 
 
194 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  23.29 
 
 
214 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  23.73 
 
 
154 aa  41.2  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  34.85 
 
 
269 aa  41.2  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  25.38 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  21.9 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  25.68 
 
 
161 aa  40.8  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  20.77 
 
 
270 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  20.77 
 
 
270 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  20.77 
 
 
270 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  19 
 
 
220 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.204819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>