89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1030 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1030  regulatory protein RecX  100 
 
 		 159 aa  322  1e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02685  putative transcriptional regulatory protein  57.96 
 
 		 159 aa  175  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0807  regulatory protein RecX  52.9 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3722  regulatory protein RecX  47.3 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.658929  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1022  regulatory protein RecX  48.23 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  45.39 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  38.93 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3293  regulatory protein RecX  44.29 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1167  hypothetical protein  35.67 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.254719 
 
 
-
 
NC_002950  PG0157  regulatory protein RecX  33.99 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  27.89 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  27.89 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  27.89 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  27.89 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  27.89 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  27.89 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  27.89 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  26.53 
 
 		 270 aa  57.4  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  26.53 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  26.17 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  26.53 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  29.46 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  32.11 
 
 		 271 aa  54.3  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  25.5 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  23.36 
 
 		 271 aa  52.8  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  26 
 
 		 214 aa  52.4  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  24.16 
 
 		 214 aa  51.2  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  28.81 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  30.51 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  30.51 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  25.17 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  32.31 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  30.23 
 
 		 156 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  29.73 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  25.52 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  27.27 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  28.24 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  29.69 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  22.38 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  24 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  31 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  29.69 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  25.53 
 
 		 210 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  30.77 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  29.23 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  30.65 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0020  regulatory protein RecX  28.26 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  29.84 
 
 		 212 aa  44.7  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  27.41 
 
 		 151 aa  44.3  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  26.85 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  28.03 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  25.85 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  23.84 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  29.41 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  27.21 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  29.41 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  26.62 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0412  recombination regulator RecX  23.91 
 
 		 258 aa  42.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  23.88 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  27.64 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  27.18 
 
 		 267 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  28.97 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  32.5 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  26.53 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  21.57 
 
 		 220 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  29.07 
 
 		 129 aa  42  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  28.07 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  28.07 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  25.37 
 
 		 271 aa  42  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  32 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  28.07 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  28.07 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  28.07 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  27.68 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  29.29 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  29.29 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  29.29 
 
 		 166 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  28.43 
 
 		 269 aa  40.8  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  29.7 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  27.72 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  31.53 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  29.29 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  29.29 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  29.7 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  29.7 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  29.7 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  26.62 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  29.35 
 
 		 222 aa  40.4  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  27.82 
 
 		 150 aa  40.4  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>