190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2010 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  100 
 
 		 151 aa  300  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  59.06 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  41.45 
 
 		 159 aa  120  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  49.28 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2007  recombination regulator RecX  46.48 
 
 		 175 aa  118  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  42.47 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  43.66 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  33.56 
 
 		 253 aa  92  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  32.67 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  38.52 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  45.16 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  37.21 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  35.82 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  35.17 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  31.25 
 
 		 214 aa  74.3  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  31.72 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  30.82 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  32.14 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  30 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 206 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  31.94 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  32.41 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  32.41 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  29.86 
 
 		 167 aa  70.1  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  36.03 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  33.11 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  37.04 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  34.33 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  35.57 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  32.37 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  32.37 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  31.65 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  37.76 
 
 		 191 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  30.94 
 
 		 174 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  34.56 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  28 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  36.73 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  26.85 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  34.35 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  27.89 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  33.82 
 
 		 198 aa  63.9  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  31.62 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  33.59 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  32.82 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  34.09 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  32.37 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  34.13 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  29.77 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  33.59 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1509  regulatory protein RecX  30.88 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99842  normal  0.151917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  32 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  32.82 
 
 		 212 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  32.06 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  32.41 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  32.86 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  30.88 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  31.03 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  32.82 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  32.59 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  28.48 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  27.33 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0139  hypothetical protein  35.62 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  27.94 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  31.71 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  32.82 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  28.24 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  37.01 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  34.95 
 
 		 257 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  28.4 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  31.17 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3947  regulatory protein RecX  30.66 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  26.67 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  26.62 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  30 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  30 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  31.76 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  31.17 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  31.17 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  31.17 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  27.59 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  31.17 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  25.36 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  31.17 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  34.18 
 
 		 222 aa  53.9  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  27.15 
 
 		 222 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  31.17 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  31.17 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  30 
 
 		 198 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  31.17 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  24.29 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1119  regulatory protein RecX  29.41 
 
 		 188 aa  52.4  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  32.26 
 
 		 271 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  27.89 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  32.17 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1022  regulatory protein RecX  30.88 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>