114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2007 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2007  recombination regulator RecX  100 
 
 		 175 aa  355  2.9999999999999997e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  50.31 
 
 		 160 aa  150  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  47.37 
 
 		 159 aa  143  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  40.88 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  46.48 
 
 		 151 aa  127  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  42.86 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  42.95 
 
 		 151 aa  94  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  31.55 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  29.38 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  30.07 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  28.76 
 
 		 214 aa  67.8  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  34.51 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  33.1 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  34.34 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  30.71 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  29.08 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  33.81 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  35.21 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  30.63 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  31.41 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  32.7 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  31.11 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  33.1 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  40 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  32.35 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  30.97 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  30.97 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  30.97 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  32.19 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  31.29 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  27.7 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  30.23 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  30.2 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  30.2 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  27.1 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  30.2 
 
 		 166 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  30.2 
 
 		 166 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  29.61 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1119  regulatory protein RecX  32.58 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  29.53 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  29.71 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  31.51 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  30.71 
 
 		 161 aa  52  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  30.6 
 
 		 153 aa  51.6  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  32.98 
 
 		 184 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1509  regulatory protein RecX  32.58 
 
 		 151 aa  51.2  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99842  normal  0.151917 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  28.67 
 
 		 156 aa  51.2  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  32.37 
 
 		 166 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  32.37 
 
 		 166 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  32.37 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  32.37 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  28.68 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  32.37 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  32.37 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  32.37 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  27.92 
 
 		 220 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  32.37 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  22.98 
 
 		 267 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0139  hypothetical protein  30.46 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  29.17 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  29.58 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  31.69 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  28.49 
 
 		 182 aa  48.5  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  29.55 
 
 		 153 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  30.85 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  29.93 
 
 		 166 aa  48.5  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  31.65 
 
 		 166 aa  48.5  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  32.12 
 
 		 129 aa  48.1  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  29.33 
 
 		 150 aa  48.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1167  hypothetical protein  26.92 
 
 		 160 aa  47.8  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.254719 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  30.71 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  27.68 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  28.06 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  38.75 
 
 		 207 aa  45.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  29.23 
 
 		 198 aa  45.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  27.66 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  31.68 
 
 		 257 aa  45.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  28.57 
 
 		 144 aa  44.7  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 144 aa  44.7  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  29.55 
 
 		 155 aa  44.7  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  29.22 
 
 		 199 aa  44.3  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  28.67 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  29.37 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1433  recombination regulator RecX  29.81 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.130729 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  27.56 
 
 		 220 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  31.85 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  31.85 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  29.13 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  27.94 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  28.37 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4684  regulatory protein RecX  26.12 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 223 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  29.41 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  23.75 
 
 		 271 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  31.96 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  28.68 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>