135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1424 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  100 
 
 		 207 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  40.41 
 
 		 225 aa  89  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  34.76 
 
 		 253 aa  85.9  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  39.6 
 
 		 167 aa  80.9  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  38.1 
 
 		 269 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  24.63 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  25.91 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  24.76 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  23.9 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  36.05 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  31.03 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  26.05 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  25 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  26.63 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  34.06 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  39.16 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  34.06 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  30.36 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  26 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  33.08 
 
 		 149 aa  67.4  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  28.87 
 
 		 152 aa  67.8  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  26.63 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  32.28 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  35.9 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  38.03 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  31.05 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  39.29 
 
 		 163 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  37.2 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1927  recombination regulator RecX  21.57 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1961  recombination regulator RecX  21.57 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  31.72 
 
 		 156 aa  62  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  35.29 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  35.61 
 
 		 154 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  36.03 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  35.44 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0200  regulatory protein RecX  36.67 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0164158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  35.71 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  34.59 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  40.8 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1411  recombination regulator RecX  21.13 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1509  regulatory protein RecX  37.6 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99842  normal  0.151917 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  23.62 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  33.83 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  37.76 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  32.58 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  35.66 
 
 		 137 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  34.44 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  29.79 
 
 		 152 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  35.97 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  36.55 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  35.81 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  31.88 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  30.72 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  34.23 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  36.11 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  35.26 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  36.11 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  26.21 
 
 		 150 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  38.27 
 
 		 150 aa  54.3  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  35.46 
 
 		 154 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  36.3 
 
 		 163 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  30.07 
 
 		 166 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  30.72 
 
 		 166 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  30.72 
 
 		 166 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  30.72 
 
 		 166 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  24.46 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  31.54 
 
 		 148 aa  53.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1548  regulatory protein RecX  31.43 
 
 		 172 aa  52.8  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  27.33 
 
 		 164 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  30.12 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  30.07 
 
 		 178 aa  52  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  36.92 
 
 		 161 aa  52  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  26.21 
 
 		 150 aa  51.6  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  37.06 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  27.86 
 
 		 151 aa  52  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  28.66 
 
 		 168 aa  51.6  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  30.83 
 
 		 165 aa  51.6  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  30.07 
 
 		 166 aa  51.6  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  30.72 
 
 		 166 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  30.72 
 
 		 166 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  30.72 
 
 		 166 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  34.11 
 
 		 152 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  30.72 
 
 		 166 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  30.72 
 
 		 166 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2407  putative regulatory protein RecX  30.99 
 
 		 171 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.457695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  29.61 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  30.07 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  30.07 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  30.07 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  33.12 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  32 
 
 		 159 aa  49.7  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  22.51 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  37.1 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1832  regulatory protein RecX  30.36 
 
 		 172 aa  48.5  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346429  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3352  regulatory protein RecX  31.16 
 
 		 151 aa  48.5  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4002  regulatory protein RecX  31.16 
 
 		 151 aa  48.5  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.610217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  32.88 
 
 		 201 aa  48.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  28.19 
 
 		 150 aa  48.1  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  32.86 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>