107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1548 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1548  regulatory protein RecX  100 
 
 		 172 aa  343  6e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1832  regulatory protein RecX  83.14 
 
 		 172 aa  264  5e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346429  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  42.21 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3294  regulatory protein RecX  40.94 
 
 		 235 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.808849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2698  recombination regulator RecX  41.72 
 
 		 293 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0651  recombination regulator RecX  41.25 
 
 		 285 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2572  recombination regulator RecX  40.49 
 
 		 293 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0672  regulatory protein RecX  42.58 
 
 		 235 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2680  recombination regulator RecX  40.83 
 
 		 302 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.521249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5978  recombination regulator RecX  40 
 
 		 289 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.129399 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2040  recombination regulator RecX  40.83 
 
 		 297 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2651  recombination regulator RecX  40.83 
 
 		 297 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0441  regulatory protein RecX  39.88 
 
 		 262 aa  101  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0273  recombination regulator RecX  40.38 
 
 		 327 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0973  recombination regulator RecX  40.38 
 
 		 327 aa  101  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4002  regulatory protein RecX  41.03 
 
 		 151 aa  101  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.610217 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2673  recombination regulator RecX  40.38 
 
 		 327 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2403  recombination regulator RecX  40.38 
 
 		 327 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0811  recombination regulator RecX  40.38 
 
 		 327 aa  101  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0016  recombination regulator RecX  40.38 
 
 		 327 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3352  regulatory protein RecX  41.03 
 
 		 151 aa  101  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0815  recombination regulator RecX  40.38 
 
 		 327 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3947  regulatory protein RecX  35 
 
 		 153 aa  99  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0644  recombination regulator RecX  40.65 
 
 		 325 aa  97.8  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490193  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4684  regulatory protein RecX  37.91 
 
 		 157 aa  97.8  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0552  recombination regulator RecX  40.12 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0456  recombination regulator RecX  36.88 
 
 		 159 aa  94.4  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0528  recombination regulator RecX  36.42 
 
 		 156 aa  94  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00754387  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4641  regulatory protein RecX  38.36 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0472  recombination regulator RecX  36.88 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5194  regulatory protein RecX  35.48 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.910753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0873  regulatory protein RecX  35.22 
 
 		 158 aa  90.5  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0020  regulatory protein RecX  36.42 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3955  regulatory protein RecX  34.64 
 
 		 168 aa  89.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0467  recombination regulator RecX  34.97 
 
 		 182 aa  89  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  36.88 
 
 		 153 aa  85.9  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  30.67 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0074  putative regulatory protein RecX  33.73 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  33.55 
 
 		 149 aa  77  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  33.12 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  31.68 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  31.45 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1591  regulatory protein RecX  35.67 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  31.29 
 
 		 182 aa  62  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  31.74 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  33.11 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  30.36 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  30.67 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  30.43 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  28.3 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  31.74 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  26.45 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  28.76 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  29.19 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  31.58 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  30 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  29.19 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  32.05 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  29.41 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  29.41 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  32.47 
 
 		 137 aa  51.2  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2015  putative inhibitor/regulator of RecA, RecX  29.07 
 
 		 373 aa  50.4  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.310936 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  26.44 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0388  recX protein  38.33 
 
 		 138 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  30.25 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  32.93 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  25.64 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  30.06 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  31.25 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  31.43 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  36.36 
 
 		 137 aa  48.5  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1982  hypothetical protein  29.31 
 
 		 411 aa  48.1  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280445 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1733  inhibitor/regulator of recA, recX  29.34 
 
 		 373 aa  47.4  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.122628  normal  0.0971818 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2746  regulatory protein RecX  29.84 
 
 		 137 aa  47.4  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  25.64 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  29.81 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  26.44 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  26.44 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  26.44 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  26.44 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  28.38 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3125  regulatory protein RecX  31.86 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3268  regulatory protein RecX  31.86 
 
 		 137 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3116  regulatory protein RecX  31.86 
 
 		 137 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  32.14 
 
 		 220 aa  44.7  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  32.86 
 
 		 152 aa  44.7  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  27.11 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  27.11 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  27.11 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  27.11 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  27.11 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  27.11 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  27.11 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 357 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  29.73 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  28.04 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  27.11 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>