89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0667 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  100 
 
 		 194 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  62.5 
 
 		 185 aa  209  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  58.86 
 
 		 254 aa  180  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  55.8 
 
 		 220 aa  177  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  58.39 
 
 		 163 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  51.37 
 
 		 222 aa  147  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  57.53 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  49.7 
 
 		 201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  53.9 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  48.75 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  43.29 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  44.12 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  44.58 
 
 		 223 aa  121  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  45.86 
 
 		 338 aa  120  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  45.9 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  49.67 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  41.92 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  39.63 
 
 		 357 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  51.02 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  44.08 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  47.86 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  40 
 
 		 217 aa  105  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  38.51 
 
 		 184 aa  100  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  44.51 
 
 		 202 aa  100  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  40.36 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  38.01 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  40.91 
 
 		 198 aa  95.9  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  39.75 
 
 		 174 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  38.01 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  38.01 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  48.53 
 
 		 137 aa  94.7  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  44.44 
 
 		 257 aa  92  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  40.14 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  32.1 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  34.76 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  35.81 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  25.9 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  40 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  37.12 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  37.41 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  31.68 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  27.52 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  34.23 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  23.42 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  30.41 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  33.12 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  27.33 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  27.87 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  25.35 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  27.54 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  26.71 
 
 		 267 aa  57.8  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  30.22 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  34.67 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  25 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  26.43 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  27.64 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  23.33 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  30.94 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  31.21 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  35.38 
 
 		 161 aa  52.4  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  31.91 
 
 		 156 aa  52  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  30.41 
 
 		 154 aa  52  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  27.27 
 
 		 160 aa  51.2  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  32.08 
 
 		 163 aa  51.2  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  29.73 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0388  recX protein  31.97 
 
 		 138 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  29.45 
 
 		 153 aa  50.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  34.51 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  21.85 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  21.85 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0285  hypothetical protein  33.08 
 
 		 149 aa  48.9  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.315039  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  30.72 
 
 		 155 aa  48.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  20.28 
 
 		 201 aa  47.8  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  32.14 
 
 		 163 aa  45.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3541  hypothetical protein  36.22 
 
 		 178 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.795937 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1618  regulatory protein RecX  36.67 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000117054  hitchhiker  0.000000000911842 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  19.77 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5814  recombination regulator RecX  39.13 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2037  regulatory protein RecX  36.29 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2438  regulatory protein RecX  24.34 
 
 		 213 aa  42.4  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000098324  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3352  regulatory protein RecX  29.2 
 
 		 151 aa  42.4  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4002  regulatory protein RecX  29.2 
 
 		 151 aa  42.4  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.610217 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  24.67 
 
 		 156 aa  42.4  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  26.32 
 
 		 204 aa  41.6  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0807  regulatory protein RecX  19.82 
 
 		 156 aa  41.6  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26893  predicted protein  29.9 
 
 		 296 aa  41.2  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.975242  normal  0.41218 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3947  regulatory protein RecX  29.73 
 
 		 153 aa  41.2  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  24.06 
 
 		 178 aa  41.2  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>