42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2037 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2037  regulatory protein RecX  100 
 
 		 200 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0520  regulatory protein RecX  76.41 
 
 		 206 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3541  hypothetical protein  62.57 
 
 		 178 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.795937 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0639  regulatory protein RecX  48.55 
 
 		 198 aa  122  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2303  hypothetical protein  55.38 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100929  hitchhiker  0.00859816 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2260  regulatory protein RecX  57.22 
 
 		 200 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.442098 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2558  hypothetical protein  42.6 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.173611 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2578  hypothetical protein  57.53 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.564298  normal  0.458172 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3064  hypothetical protein  39.78 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1418  hypothetical protein  36.22 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4526  recombination regulator RecX  37.3 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0822  hypothetical protein  33.16 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5814  recombination regulator RecX  37.04 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.449871  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4261  recombination regulator RecX  34.03 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  39.75 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3614  regulatory protein RecX  32.02 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0968404  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  39.52 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  41.54 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  40 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  40.31 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  39.67 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  34.62 
 
 		 163 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  36.88 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  35.19 
 
 		 338 aa  49.7  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  35.9 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  32.34 
 
 		 191 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  34.18 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  34.87 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  32.47 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  36 
 
 		 226 aa  45.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  34.19 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  39.33 
 
 		 152 aa  44.7  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  34.15 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  36.13 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  38.46 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1618  regulatory protein RecX  39.02 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000117054  hitchhiker  0.000000000911842 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  34.36 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  34.29 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  33.94 
 
 		 225 aa  42.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 149 aa  42.4  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  30.72 
 
 		 357 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  29.37 
 
 		 204 aa  42  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>