84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_07240 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  100 
 
 
338 aa  636    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  52.6 
 
 
223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  49.44 
 
 
192 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  53.8 
 
 
202 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  52.6 
 
 
160 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  36.63 
 
 
357 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  50.32 
 
 
205 aa  132  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  50.92 
 
 
222 aa  132  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  47.67 
 
 
220 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  50.32 
 
 
198 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  44.44 
 
 
226 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  47.93 
 
 
220 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  48.24 
 
 
201 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  45.03 
 
 
194 aa  123  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  47.83 
 
 
179 aa  123  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  51.88 
 
 
186 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  44.95 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  46.2 
 
 
185 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  47.77 
 
 
163 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  46.34 
 
 
184 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  44 
 
 
191 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  43.95 
 
 
170 aa  109  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  40.76 
 
 
217 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  44.12 
 
 
183 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  44.38 
 
 
174 aa  106  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  44.12 
 
 
183 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  44.12 
 
 
183 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  45 
 
 
216 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  44.97 
 
 
199 aa  89.4  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  45.83 
 
 
137 aa  89.7  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  47.95 
 
 
167 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  40.99 
 
 
176 aa  87.4  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  36.36 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  39.26 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  29.68 
 
 
152 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  34.94 
 
 
228 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  38.02 
 
 
127 aa  67  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  26.9 
 
 
212 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  28.66 
 
 
253 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  31.65 
 
 
229 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  26.22 
 
 
212 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  36.21 
 
 
195 aa  63.5  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  31.41 
 
 
227 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  27.7 
 
 
210 aa  59.7  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  28.97 
 
 
214 aa  56.2  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  32.56 
 
 
178 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  40.41 
 
 
149 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  37.5 
 
 
159 aa  53.1  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  30.77 
 
 
167 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  28.97 
 
 
214 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  32.24 
 
 
221 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  28.7 
 
 
217 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  33.33 
 
 
151 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  40.17 
 
 
161 aa  50.4  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  34.97 
 
 
179 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0285  hypothetical protein  35.16 
 
 
149 aa  50.1  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.315039  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  29.9 
 
 
214 aa  49.7  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  36.59 
 
 
153 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  41.89 
 
 
149 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4684  regulatory protein RecX  30.77 
 
 
157 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  34 
 
 
163 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  31.9 
 
 
187 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  31.9 
 
 
182 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3614  regulatory protein RecX  33.33 
 
 
177 aa  47  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0968404  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  35.21 
 
 
155 aa  46.6  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  29.36 
 
 
156 aa  46.6  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  32.89 
 
 
154 aa  46.2  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  34.78 
 
 
160 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  32.7 
 
 
156 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1020  regulatory protein RecX  34.94 
 
 
222 aa  44.3  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2037  regulatory protein RecX  31.17 
 
 
200 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1618  regulatory protein RecX  33.57 
 
 
225 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000117054  hitchhiker  0.000000000911842 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0672  regulatory protein RecX  30.69 
 
 
235 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  35.92 
 
 
156 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  31.61 
 
 
225 aa  43.5  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  30.87 
 
 
156 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  25.5 
 
 
206 aa  43.1  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2651  recombination regulator RecX  33.58 
 
 
297 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2040  recombination regulator RecX  33.58 
 
 
297 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  37.5 
 
 
150 aa  43.5  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  31.48 
 
 
168 aa  42.7  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2698  recombination regulator RecX  32.85 
 
 
293 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  32.91 
 
 
148 aa  42.7  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  35.8 
 
 
222 aa  42.4  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>