99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2447 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  100 
 
 		 186 aa  341  2.9999999999999997e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  61.68 
 
 		 201 aa  175  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  56.07 
 
 		 222 aa  158  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  59.73 
 
 		 163 aa  153  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  57.23 
 
 		 223 aa  153  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  54.72 
 
 		 220 aa  151  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  53.09 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  49.67 
 
 		 357 aa  138  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  52.12 
 
 		 202 aa  137  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  46.81 
 
 		 220 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  52.17 
 
 		 338 aa  134  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  55.7 
 
 		 216 aa  133  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  50.63 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  51.66 
 
 		 226 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  49.42 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  48.89 
 
 		 254 aa  132  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  45.9 
 
 		 194 aa  131  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  50.63 
 
 		 160 aa  127  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  53.69 
 
 		 217 aa  127  7.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  48.41 
 
 		 184 aa  120  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  46.81 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  52.98 
 
 		 199 aa  118  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  45.56 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  45.56 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  44.97 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  46.5 
 
 		 191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  56.03 
 
 		 257 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  43.31 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  46.95 
 
 		 202 aa  104  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  46.01 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  52.86 
 
 		 137 aa  102  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  47.52 
 
 		 167 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  41.4 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  41.45 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0285  hypothetical protein  40.67 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.315039  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  42.86 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  30.07 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  38.85 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  32.21 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  27.06 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  30.87 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  36.69 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  33.52 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  33.97 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  23.46 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  26.45 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  27.08 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  23.46 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  26.9 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  25.81 
 
 		 267 aa  57.8  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  28.04 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  31.62 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1618  regulatory protein RecX  37.23 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000117054  hitchhiker  0.000000000911842 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  30.26 
 
 		 167 aa  51.6  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1020  regulatory protein RecX  36.42 
 
 		 222 aa  51.2  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2438  regulatory protein RecX  26.53 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000098324  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  37.5 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  23.97 
 
 		 270 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  27.89 
 
 		 271 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  35.62 
 
 		 149 aa  48.9  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  22.7 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  29.92 
 
 		 150 aa  48.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  32.39 
 
 		 179 aa  48.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  30.34 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3541  hypothetical protein  36.07 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.795937 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  21.62 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  26.32 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  24.11 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  24.34 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  28.78 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  33.86 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10730  hypothetical protein  34.07 
 
 		 177 aa  45.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0103312  unclonable  0.00000000098721 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  20.88 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2037  regulatory protein RecX  33.85 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104777 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  32.86 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  23.81 
 
 		 269 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1832  regulatory protein RecX  30.72 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346429  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0520  regulatory protein RecX  45.71 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  22.15 
 
 		 270 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  21.48 
 
 		 270 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  28.08 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  21.48 
 
 		 270 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  21.48 
 
 		 270 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  21.48 
 
 		 270 aa  42.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  33.86 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  21.48 
 
 		 270 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  21.48 
 
 		 270 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  21.48 
 
 		 270 aa  42  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  35.63 
 
 		 161 aa  42  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  21.48 
 
 		 270 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2407  putative regulatory protein RecX  30.32 
 
 		 171 aa  42  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.457695  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  23.3 
 
 		 271 aa  41.6  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1474  regulatory protein RecX  34.56 
 
 		 217 aa  41.6  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000363384  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  27.82 
 
 		 151 aa  41.6  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  26.35 
 
 		 148 aa  41.2  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  31.11 
 
 		 149 aa  40.8  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>