58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1020 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1020  regulatory protein RecX  100 
 
 		 222 aa  454  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0285  hypothetical protein  48.98 
 
 		 149 aa  142  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.315039  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  36.52 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  35.14 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  34.31 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  32.68 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  32 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  26.06 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  34.62 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  34.01 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  31.21 
 
 		 179 aa  52  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  26.92 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  34.81 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  34.07 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  34.07 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  33.05 
 
 		 178 aa  50.1  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  38.46 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  36.42 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  38.27 
 
 		 129 aa  49.3  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  27.65 
 
 		 159 aa  49.3  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  32.26 
 
 		 357 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  40 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  32.17 
 
 		 152 aa  48.9  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  32.89 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  26.11 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  27.85 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  35.85 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  26.45 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  29.58 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  28.47 
 
 		 161 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  38.3 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  28.47 
 
 		 161 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  31.82 
 
 		 152 aa  47  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  25.64 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  26.67 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  27.74 
 
 		 176 aa  45.8  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  33.08 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  27.38 
 
 		 159 aa  45.8  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  24.83 
 
 		 214 aa  45.4  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  33.75 
 
 		 160 aa  45.1  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  25.97 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  27.16 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  34.94 
 
 		 338 aa  44.7  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  38.37 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  29.2 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  28.97 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  26.76 
 
 		 150 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  32.1 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  25.32 
 
 		 155 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  31.79 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  31.97 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  28.65 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  23.9 
 
 		 267 aa  42.4  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  26.67 
 
 		 224 aa  42.7  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  30.15 
 
 		 185 aa  42.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  34.48 
 
 		 170 aa  42  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  23.08 
 
 		 151 aa  42  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  31.25 
 
 		 137 aa  41.6  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>