60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1491 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  100 
 
 		 127 aa  244  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  47.27 
 
 		 220 aa  97.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  46.36 
 
 		 202 aa  92.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  46.36 
 
 		 185 aa  85.1  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  46.85 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  43.64 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  40.18 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  44.54 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  43.64 
 
 		 254 aa  80.5  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  44.86 
 
 		 220 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  44.86 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  48.45 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  40.37 
 
 		 357 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  42.86 
 
 		 217 aa  74.3  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  39.2 
 
 		 201 aa  73.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  40 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  45.13 
 
 		 202 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  42.86 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  38.02 
 
 		 338 aa  67.4  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  41.82 
 
 		 222 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  42.73 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  41.82 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  42.73 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  38.14 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  40.52 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  40.91 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  42.86 
 
 		 186 aa  63.9  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  38.14 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  39.81 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  33.83 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  43.64 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  34.21 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  34.95 
 
 		 227 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  29.36 
 
 		 253 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  35.45 
 
 		 167 aa  52.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  29.36 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  30.33 
 
 		 214 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  35.9 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  29.46 
 
 		 217 aa  51.2  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  31.73 
 
 		 214 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  30.33 
 
 		 214 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0285  hypothetical protein  35.29 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.315039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  34.55 
 
 		 152 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 152 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  30.4 
 
 		 223 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  29.91 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  29.57 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  39.09 
 
 		 225 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  39.22 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  45.76 
 
 		 257 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  30.21 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  35.29 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3614  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0968404  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  26.13 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  31.19 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  37.29 
 
 		 176 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  29.79 
 
 		 162 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  29.35 
 
 		 270 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  32.71 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2558  hypothetical protein  30.84 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.173611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>