156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2350 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  100 
 
 		 160 aa  321  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  52.87 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  48.39 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2007  recombination regulator RecX  50.31 
 
 		 175 aa  137  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  46.36 
 
 		 178 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  42.47 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  45.21 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  34.53 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  32.47 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  29.45 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  31.34 
 
 		 214 aa  70.5  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  33.81 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  33.09 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  34.81 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  29.29 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  30.46 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  32.64 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  34.53 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  30.23 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  32.24 
 
 		 228 aa  64.3  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  31.91 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  31.91 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  31.94 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  32.61 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  31.21 
 
 		 183 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  36.69 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  29.61 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  33.82 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  30 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  29.55 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  33.08 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  35 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  33.01 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  33.77 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  34.38 
 
 		 222 aa  57.4  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  30.72 
 
 		 162 aa  57  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  33.09 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  32.35 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  38.89 
 
 		 207 aa  57  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  30.88 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  30.6 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  30.6 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  34.09 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  31.25 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  27.27 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  30.28 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  24.36 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  29.71 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  30.71 
 
 		 202 aa  53.9  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  34.85 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  34.09 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  31.2 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  31.39 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  29.45 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  38.64 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  30.22 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  33.33 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  30.63 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  33.8 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  33.86 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  32.58 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  33.09 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  27.85 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2040  recombination regulator RecX  31.82 
 
 		 297 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2651  recombination regulator RecX  31.82 
 
 		 297 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  32.09 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  31.79 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  30.64 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  30.82 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  28.03 
 
 		 222 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  32.65 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  31.39 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0651  recombination regulator RecX  32.03 
 
 		 285 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  26.52 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  30.83 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  27.27 
 
 		 194 aa  51.2  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  32.58 
 
 		 226 aa  51.2  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  29.79 
 
 		 176 aa  50.8  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2572  recombination regulator RecX  31.06 
 
 		 293 aa  50.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  30.38 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5978  recombination regulator RecX  32.03 
 
 		 289 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.129399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  29.89 
 
 		 216 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  29.78 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  31.11 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  33.59 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3016  regulatory protein RecX  28.77 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  31.94 
 
 		 212 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  25.49 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  32.28 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>