158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1832 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  100 
 
 		 210 aa  420  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  31.88 
 
 		 253 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  31.75 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  31.58 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  30.95 
 
 		 267 aa  107  9.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  30.14 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  29.67 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  30.58 
 
 		 206 aa  98.2  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  38.62 
 
 		 152 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  31.28 
 
 		 229 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  32.86 
 
 		 264 aa  95.5  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  31.6 
 
 		 270 aa  89.7  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  34.18 
 
 		 271 aa  88.6  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  35 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  30.66 
 
 		 270 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  30.66 
 
 		 270 aa  85.1  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  30.66 
 
 		 270 aa  85.1  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  30.66 
 
 		 270 aa  84.7  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  30.66 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  30.66 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  30.66 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  27.27 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  29.72 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1411  recombination regulator RecX  30.29 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  28.18 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  27.96 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  27.73 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  30.19 
 
 		 270 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  25.36 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1927  recombination regulator RecX  28.85 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1961  recombination regulator RecX  28.85 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  29.72 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  32.67 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  26.19 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  28.23 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  34.75 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  37.21 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  31.03 
 
 		 165 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  27.38 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  31.55 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  34.53 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  27.95 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  30.67 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  29.44 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2007  recombination regulator RecX  31.55 
 
 		 175 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  25.9 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  32.87 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  30.61 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  28.76 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  33.1 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  27.46 
 
 		 163 aa  72  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  29.41 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  34.97 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  30.87 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  30.87 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  30.2 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  32.39 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  29.8 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  35.53 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  32.87 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  32.82 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  25.91 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  37.82 
 
 		 129 aa  67.8  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  30.87 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  25 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  33.81 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  32.35 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  31.33 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  26.75 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  29.79 
 
 		 156 aa  64.7  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  29.22 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  28.36 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  27.89 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  31.62 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  28.89 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  26.29 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  27.85 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  30.71 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  32.41 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  29.93 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  23.4 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  27.7 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  26.45 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  27.69 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  30.99 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  31.06 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  29.8 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  32.88 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  30.28 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  26.37 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  29.23 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  22.54 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  27.06 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  27.89 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  25.79 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  30.51 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  28.1 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1022  regulatory protein RecX  28.99 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  34.33 
 
 		 155 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>