169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0842 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  100 
 
 
168 aa  348  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  69.83 
 
 
182 aa  249  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  67.39 
 
 
187 aa  246  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  54.44 
 
 
162 aa  177  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  54.76 
 
 
164 aa  174  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  51.83 
 
 
166 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  51.83 
 
 
166 aa  166  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  51.83 
 
 
166 aa  166  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  51.83 
 
 
166 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  51.83 
 
 
166 aa  166  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  51.81 
 
 
166 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  51.81 
 
 
166 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  51.83 
 
 
166 aa  166  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  51.83 
 
 
166 aa  166  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  51.83 
 
 
166 aa  166  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  51.81 
 
 
166 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  51.2 
 
 
166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  50.9 
 
 
162 aa  164  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  51.22 
 
 
166 aa  164  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  53.29 
 
 
162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  51.2 
 
 
166 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  49.39 
 
 
166 aa  159  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  40.76 
 
 
149 aa  114  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  36.54 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  38.06 
 
 
153 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  39.47 
 
 
152 aa  94  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  36.77 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  35.48 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  38.78 
 
 
155 aa  92  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  35.48 
 
 
155 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  34.69 
 
 
152 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  36.91 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  34.93 
 
 
143 aa  89.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  36.84 
 
 
155 aa  89.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  34.93 
 
 
143 aa  89.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  31.87 
 
 
162 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  34.39 
 
 
155 aa  87.4  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  34.39 
 
 
150 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  38.65 
 
 
152 aa  85.9  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  37.01 
 
 
154 aa  85.1  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  31.37 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  33.33 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  30.72 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  33.78 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  30.63 
 
 
163 aa  80.9  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3016  regulatory protein RecX  33.99 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  32.9 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  34.01 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  33.11 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  32.89 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  32.89 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  32.32 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  32.32 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  29.09 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  30.91 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  31.68 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3294  regulatory protein RecX  36.65 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.808849  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0388  recX protein  33.99 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1591  regulatory protein RecX  31.85 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  31.13 
 
 
160 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  31.29 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2746  regulatory protein RecX  36.61 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  33.54 
 
 
153 aa  72  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4684  regulatory protein RecX  32.5 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  31.48 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0672  regulatory protein RecX  35.4 
 
 
235 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  31.33 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  29.63 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  35.53 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5194  regulatory protein RecX  32.93 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.910753  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3116  regulatory protein RecX  34.82 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3125  regulatory protein RecX  34.82 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3268  regulatory protein RecX  34.82 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3352  regulatory protein RecX  29.19 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4002  regulatory protein RecX  29.19 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.610217 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0552  recombination regulator RecX  31.45 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3947  regulatory protein RecX  32.92 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2572  recombination regulator RecX  35.03 
 
 
293 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  32.93 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0933  regulatory protein RecX  34.62 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1051  regulatory protein RecX  34.62 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0599786 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  30.72 
 
 
152 aa  63.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  33.55 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0815  recombination regulator RecX  31.68 
 
 
327 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1832  regulatory protein RecX  31.85 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  33.73 
 
 
152 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0273  recombination regulator RecX  31.68 
 
 
327 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0973  recombination regulator RecX  31.68 
 
 
327 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5978  recombination regulator RecX  34.39 
 
 
289 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.129399 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2673  recombination regulator RecX  31.68 
 
 
327 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2403  recombination regulator RecX  31.68 
 
 
327 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0811  recombination regulator RecX  31.68 
 
 
327 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0441  regulatory protein RecX  33.33 
 
 
262 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0016  recombination regulator RecX  31.68 
 
 
327 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1982  hypothetical protein  30.25 
 
 
411 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280445 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2698  recombination regulator RecX  34.87 
 
 
293 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2040  recombination regulator RecX  33.33 
 
 
297 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2651  recombination regulator RecX  33.33 
 
 
297 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1548  regulatory protein RecX  33.11 
 
 
172 aa  61.2  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023294  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  30.19 
 
 
152 aa  60.8  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>