132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0427 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  100 
 
 		 159 aa  322  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  48.39 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  44.37 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2007  recombination regulator RecX  47.37 
 
 		 175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  41.45 
 
 		 151 aa  120  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  42.67 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  39.86 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  32.67 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  30.99 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  30.43 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  30.82 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  31.79 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  30.43 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  42.42 
 
 		 183 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  42.42 
 
 		 183 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  41.41 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  31.08 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  40.21 
 
 		 191 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  28.78 
 
 		 159 aa  67  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  34.31 
 
 		 199 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  34.31 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  31.16 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  38.14 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  31.54 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  30.41 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  40.21 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  35.23 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  29.73 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  37 
 
 		 257 aa  58.2  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  29.93 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  25.71 
 
 		 217 aa  57  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  30.37 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  32.17 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  28.29 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  30.3 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  29.52 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  29.86 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  31.94 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  34.48 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  30.07 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  30.87 
 
 		 227 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1022  regulatory protein RecX  28.47 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  29.79 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  28.17 
 
 		 212 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  30.56 
 
 		 220 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  36.27 
 
 		 338 aa  53.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  29.68 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  30.83 
 
 		 254 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  33.7 
 
 		 222 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  28.17 
 
 		 212 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  31.43 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  30.6 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  41.1 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  30.41 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  32.56 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  29.86 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  29.63 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  29.3 
 
 		 221 aa  52.4  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  26.8 
 
 		 220 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 186 aa  51.2  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0157  regulatory protein RecX  24.46 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  23.38 
 
 		 267 aa  50.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  27.56 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  29.41 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  30.34 
 
 		 202 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0285  hypothetical protein  34.88 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.315039  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  30.19 
 
 		 201 aa  48.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  29.17 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  27.14 
 
 		 198 aa  47.8  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  28.91 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  28.79 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4002  regulatory protein RecX  28.89 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.610217 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3352  regulatory protein RecX  28.89 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  30.28 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  29.89 
 
 		 216 aa  47  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  27.27 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1020  regulatory protein RecX  26.47 
 
 		 222 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  36.67 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1832  regulatory protein RecX  32.47 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346429  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  28.78 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  30.88 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  32.89 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  28.1 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0651  recombination regulator RecX  32.39 
 
 		 285 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  28.1 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2680  recombination regulator RecX  33.57 
 
 		 302 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.521249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2040  recombination regulator RecX  32.39 
 
 		 297 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  25.76 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  30.66 
 
 		 225 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2651  recombination regulator RecX  32.39 
 
 		 297 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  30.16 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  30.09 
 
 		 179 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  27.86 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  28.47 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2572  recombination regulator RecX  33.56 
 
 		 293 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4684  regulatory protein RecX  28.47 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  25.55 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  28.47 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  27.74 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5978  recombination regulator RecX  32.19 
 
 		 289 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.129399 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>