74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1546 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  100 
 
 		 201 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  60.92 
 
 		 186 aa  167  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  53.53 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  50.28 
 
 		 202 aa  155  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  52.84 
 
 		 185 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  46.2 
 
 		 357 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  49.74 
 
 		 254 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  55.92 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  49.7 
 
 		 194 aa  144  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  49.4 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  56.52 
 
 		 216 aa  138  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  48.02 
 
 		 222 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  52.15 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  53.05 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  46.51 
 
 		 220 aa  127  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  48.7 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  54.29 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  43.98 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  49.37 
 
 		 338 aa  124  9e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  45.03 
 
 		 179 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  47.96 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  49.33 
 
 		 160 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  54.48 
 
 		 137 aa  119  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  50.33 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  41.95 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  41.95 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  41.95 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  48.94 
 
 		 167 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  39.88 
 
 		 184 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  41.94 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  38.73 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  39.63 
 
 		 198 aa  93.2  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  32.61 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  39.2 
 
 		 127 aa  73.6  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  34.94 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  37.28 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  28.93 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  36.05 
 
 		 176 aa  62  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  33.55 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  34.27 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  22.6 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0285  hypothetical protein  36.43 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.315039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  24.52 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  23.03 
 
 		 159 aa  52  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  30.87 
 
 		 163 aa  51.6  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  36.59 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  24.46 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  34.51 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  35.46 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  27.33 
 
 		 167 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  23.12 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  28.44 
 
 		 178 aa  48.5  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  25.34 
 
 		 214 aa  48.1  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  31.03 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  28.95 
 
 		 162 aa  47.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  30.19 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  31.91 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  20.71 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  38.83 
 
 		 161 aa  47.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  23.24 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  32.19 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2438  regulatory protein RecX  25.74 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000098324  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  27.08 
 
 		 152 aa  45.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  29.89 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  31.94 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  34.21 
 
 		 153 aa  44.7  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4641  regulatory protein RecX  33.76 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  33.68 
 
 		 137 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  19.67 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  37.31 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  28.16 
 
 		 149 aa  42  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2558  hypothetical protein  33.93 
 
 		 181 aa  41.6  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.173611 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  24.03 
 
 		 164 aa  41.6  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  25.42 
 
 		 153 aa  41.2  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>