60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0285 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0285  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  292  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.315039  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1020  regulatory protein RecX  48.98 
 
 		 222 aa  127  4.0000000000000003e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  40.94 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  38.81 
 
 		 217 aa  70.9  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  40.85 
 
 		 216 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  41.04 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  36.88 
 
 		 220 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  39.19 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  40.67 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  33.58 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  35.71 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  32.87 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  30.28 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  29.73 
 
 		 253 aa  53.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  33.58 
 
 		 192 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  36.43 
 
 		 201 aa  52.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  25 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  33.77 
 
 		 225 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  44.16 
 
 		 183 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  30.52 
 
 		 223 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  35.16 
 
 		 338 aa  50.4  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1491  regulatory protein RecX  35.29 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  25.34 
 
 		 214 aa  50.1  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  31.16 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  31.72 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  26.03 
 
 		 214 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  44.16 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  44.16 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  30.34 
 
 		 198 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  33.08 
 
 		 194 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  32.14 
 
 		 222 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  32.14 
 
 		 227 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  27.52 
 
 		 228 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  34.88 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 229 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  23.33 
 
 		 217 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  26.03 
 
 		 214 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  37.01 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  33.85 
 
 		 254 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 212 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  27.93 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  40 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  38.75 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  28.1 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 212 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 220 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  32.43 
 
 		 221 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  33.07 
 
 		 168 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  28.18 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 154 aa  43.5  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  31.96 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  32.33 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  27.03 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  34.51 
 
 		 257 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  27.74 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  30.83 
 
 		 357 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  26.74 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  40 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  31.85 
 
 		 226 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  29.08 
 
 		 198 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>