146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2821 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  100 
 
 		 166 aa  343  7e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  99.4 
 
 		 166 aa  340  4e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  99.4 
 
 		 166 aa  340  4e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  98.8 
 
 		 166 aa  339  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  98.8 
 
 		 166 aa  339  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  98.8 
 
 		 166 aa  339  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  98.8 
 
 		 166 aa  339  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  98.8 
 
 		 166 aa  339  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  98.8 
 
 		 166 aa  338  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  87.35 
 
 		 166 aa  308  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  87.35 
 
 		 166 aa  308  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  87.35 
 
 		 166 aa  307  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  86.75 
 
 		 166 aa  306  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  86.14 
 
 		 166 aa  302  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  85.54 
 
 		 166 aa  298  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  51.83 
 
 		 168 aa  166  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  51.61 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  48.75 
 
 		 164 aa  150  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  45.66 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  44.38 
 
 		 187 aa  147  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  47.83 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  45.28 
 
 		 162 aa  144  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  39.47 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  42.28 
 
 		 153 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  40.27 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  41.1 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  41.96 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  39.86 
 
 		 152 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  37.67 
 
 		 150 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  37.5 
 
 		 156 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  37.06 
 
 		 145 aa  90.9  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  37.14 
 
 		 156 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  35.86 
 
 		 143 aa  87.4  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  35.86 
 
 		 143 aa  87.4  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  37.14 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  34.04 
 
 		 150 aa  85.5  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  39.29 
 
 		 155 aa  85.9  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  34.67 
 
 		 163 aa  84.7  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2746  regulatory protein RecX  37.17 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  36.43 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  36.43 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  39.26 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  36.43 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  38.57 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3116  regulatory protein RecX  35.96 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3125  regulatory protein RecX  35.96 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3268  regulatory protein RecX  35.96 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  34.44 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  32.17 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1591  regulatory protein RecX  32.48 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  31.79 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  35.51 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  31.13 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  34.21 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  35.51 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  35.29 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  35.37 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  34.18 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  29.86 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  30.66 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0388  recX protein  34.75 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3016  regulatory protein RecX  32.48 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  34.23 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  30.77 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  30.34 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4684  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  34.53 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  28 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  33.56 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1733  inhibitor/regulator of recA, recX  31.45 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.122628  normal  0.0971818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  31.29 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1126  regulatory protein RecX  36.19 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4386  hypothetical protein  38.32 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.684002  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3429  regulatory protein RecX  33.94 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  33.54 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1127  regulatory protein RecX  35.24 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  31.65 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0552  recombination regulator RecX  30.15 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0456  recombination regulator RecX  28.68 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  33.12 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2015  putative inhibitor/regulator of RecA, RecX  30.13 
 
 		 373 aa  55.8  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.310936 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1051  regulatory protein RecX  32.69 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0599786 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0933  regulatory protein RecX  32.69 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5194  regulatory protein RecX  30 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.910753  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  32.5 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0672  regulatory protein RecX  33.54 
 
 		 235 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0472  recombination regulator RecX  27.94 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  29.79 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  27.33 
 
 		 206 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  30 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  30 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  31.17 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3294  regulatory protein RecX  34.15 
 
 		 235 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.808849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5978  recombination regulator RecX  31.45 
 
 		 289 aa  51.2  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.129399 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  28.19 
 
 		 154 aa  50.8  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  31.97 
 
 		 178 aa  50.8  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2572  recombination regulator RecX  31.29 
 
 		 293 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0441  regulatory protein RecX  32.93 
 
 		 262 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>