53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10540 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_10540  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  372  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.405864  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  37.71 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  38.76 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  35.96 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  37.5 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  37.95 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  36 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  38.41 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  29.44 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  45.21 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  39.06 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  39.47 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  35.03 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  37.28 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  38.82 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  35.48 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  34.88 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  34.88 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  34.3 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  37.58 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  34.68 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  32.41 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  34.3 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  37.5 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  34.9 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07240  regulatory protein RecX  36.18 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.858838  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  31.03 
 
 		 227 aa  62  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  37.5 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  36.73 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  29.27 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  31.25 
 
 		 167 aa  61.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  32.59 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  31.51 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  36.54 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  34.67 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  26.54 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  30.32 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  38.52 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  34.31 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  32.19 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  35.17 
 
 		 137 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  29.55 
 
 		 357 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  25.79 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  33.87 
 
 		 257 aa  48.9  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  31.39 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  32.98 
 
 		 151 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  30.34 
 
 		 269 aa  45.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  29.41 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  24.53 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  28.24 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  21.51 
 
 		 163 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  29.9 
 
 		 156 aa  42  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  31.29 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>