181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0710 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  100 
 
 		 149 aa  290  6e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  53.24 
 
 		 157 aa  133  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  46.76 
 
 		 155 aa  114  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0020  regulatory protein RecX  43.45 
 
 		 150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5194  regulatory protein RecX  45.27 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.910753  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  47.52 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0873  regulatory protein RecX  44.3 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0441  regulatory protein RecX  43.17 
 
 		 262 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0644  recombination regulator RecX  44.44 
 
 		 325 aa  103  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490193  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0552  recombination regulator RecX  44.6 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4684  regulatory protein RecX  42.86 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2040  recombination regulator RecX  46.04 
 
 		 297 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2572  recombination regulator RecX  46.04 
 
 		 293 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2651  recombination regulator RecX  46.04 
 
 		 297 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2698  recombination regulator RecX  45.32 
 
 		 293 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0273  recombination regulator RecX  43.06 
 
 		 327 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0973  recombination regulator RecX  43.06 
 
 		 327 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2673  recombination regulator RecX  43.06 
 
 		 327 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2403  recombination regulator RecX  43.06 
 
 		 327 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0811  recombination regulator RecX  43.06 
 
 		 327 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0815  recombination regulator RecX  43.06 
 
 		 327 aa  100  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0016  recombination regulator RecX  43.06 
 
 		 327 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0467  recombination regulator RecX  40.69 
 
 		 182 aa  100  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0528  recombination regulator RecX  40.28 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00754387  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0651  recombination regulator RecX  46.76 
 
 		 285 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5978  recombination regulator RecX  44.6 
 
 		 289 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.129399 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2680  recombination regulator RecX  45.32 
 
 		 302 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.521249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0456  recombination regulator RecX  40.58 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3352  regulatory protein RecX  45 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4002  regulatory protein RecX  45 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.610217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3955  regulatory protein RecX  40 
 
 		 168 aa  97.1  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0472  recombination regulator RecX  40.58 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  42.96 
 
 		 185 aa  96.7  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  46.85 
 
 		 155 aa  96.3  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3947  regulatory protein RecX  40.14 
 
 		 153 aa  94.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  45.71 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  46.9 
 
 		 152 aa  93.6  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0672  regulatory protein RecX  40.29 
 
 		 235 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  44.12 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3294  regulatory protein RecX  39.57 
 
 		 235 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.808849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  43.26 
 
 		 155 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  42.55 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  43.26 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  47.45 
 
 		 161 aa  88.2  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4641  regulatory protein RecX  44.2 
 
 		 156 aa  87.8  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  43.97 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  42.55 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  44.44 
 
 		 156 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0074  putative regulatory protein RecX  35.8 
 
 		 169 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  37.41 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  42.07 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  38.73 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  42.55 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  42.55 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  41.38 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  41.84 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  39.19 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  41.33 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1548  regulatory protein RecX  33.55 
 
 		 172 aa  77  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1832  regulatory protein RecX  34 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346429  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  37.76 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  39.16 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  31.29 
 
 		 168 aa  72  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  34.53 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  40.94 
 
 		 168 aa  70.5  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  37.41 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0388  recX protein  42.11 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  33.81 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  38.81 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1509  regulatory protein RecX  36.29 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99842  normal  0.151917 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  33.09 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0933  regulatory protein RecX  39.37 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1051  regulatory protein RecX  39.37 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0599786 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  36.88 
 
 		 178 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  38.3 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  27.54 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  35.37 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  39.85 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1982  hypothetical protein  30.25 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280445 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  33.09 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  31.97 
 
 		 163 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  29.29 
 
 		 220 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  36.36 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  25.86 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  38.03 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  41.46 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  26.67 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  30.15 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  37.32 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  25.14 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  32.93 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  28.21 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  32.73 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3016  regulatory protein RecX  30.94 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  30.94 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  30.94 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  33.12 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>