71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_0516 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  100 
 
 
270 aa  537  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  100 
 
 
270 aa  537  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  100 
 
 
270 aa  537  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  99.63 
 
 
270 aa  536  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  99.26 
 
 
270 aa  533  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  99.26 
 
 
270 aa  533  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  98.89 
 
 
270 aa  530  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  96.28 
 
 
270 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  96.3 
 
 
270 aa  500  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  92.96 
 
 
270 aa  484  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  85.56 
 
 
270 aa  455  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  44.11 
 
 
271 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  35.85 
 
 
269 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  35.74 
 
 
264 aa  152  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  35.21 
 
 
271 aa  145  8.000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  34.6 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  34.6 
 
 
271 aa  133  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  33.48 
 
 
269 aa  105  9e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1411  recombination regulator RecX  30.65 
 
 
267 aa  104  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1961  recombination regulator RecX  29.43 
 
 
272 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1927  recombination regulator RecX  29.43 
 
 
272 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0422  recombination regulator RecX  30.38 
 
 
258 aa  88.6  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0412  recombination regulator RecX  28.52 
 
 
258 aa  87  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  30.66 
 
 
210 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  28.64 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  25.81 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  30.77 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  30.24 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  23.96 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  27.72 
 
 
217 aa  63.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  23.27 
 
 
214 aa  62  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  26.89 
 
 
225 aa  62  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  22.54 
 
 
221 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  23.11 
 
 
214 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  29.58 
 
 
156 aa  61.2  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  22.64 
 
 
214 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  32.92 
 
 
206 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  20.75 
 
 
229 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  27.52 
 
 
151 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  35.03 
 
 
198 aa  55.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3722  regulatory protein RecX  23.91 
 
 
161 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.658929  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  25.17 
 
 
183 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  25.17 
 
 
183 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  27.34 
 
 
163 aa  52.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  24.5 
 
 
183 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  23.44 
 
 
223 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  25.87 
 
 
357 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  31.91 
 
 
129 aa  50.4  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  25.17 
 
 
176 aa  50.4  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  25.36 
 
 
160 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1030  regulatory protein RecX  27.89 
 
 
159 aa  50.4  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  24.09 
 
 
220 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  28.97 
 
 
152 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  27.63 
 
 
151 aa  49.3  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  26.95 
 
 
201 aa  48.9  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  29.05 
 
 
150 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1022  regulatory protein RecX  26.75 
 
 
153 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  27.89 
 
 
152 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  23.91 
 
 
192 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  28.38 
 
 
150 aa  46.2  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2438  regulatory protein RecX  28.07 
 
 
213 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000098324  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  29.22 
 
 
159 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  24.82 
 
 
179 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_002950  PG0157  regulatory protein RecX  28.3 
 
 
161 aa  45.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3293  regulatory protein RecX  24.26 
 
 
150 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  23.49 
 
 
191 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  27.56 
 
 
167 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  21.68 
 
 
199 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  26.36 
 
 
150 aa  42.7  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  22.82 
 
 
163 aa  42  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  21.09 
 
 
254 aa  42  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>