88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1292 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  100 
 
 		 150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  59.69 
 
 		 129 aa  157  5e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  43.05 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  41.73 
 
 		 161 aa  94.7  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  41.73 
 
 		 161 aa  94.4  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  35.21 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  41.58 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  36.36 
 
 		 253 aa  60.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  30.53 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  41.38 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  30.88 
 
 		 225 aa  57.8  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  28.06 
 
 		 264 aa  57.4  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  33.65 
 
 		 206 aa  57  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  28.3 
 
 		 227 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  26.28 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  27.59 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  27.59 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  27.59 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  32.76 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  34.44 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  38.27 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  31.11 
 
 		 229 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  26.36 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  31.34 
 
 		 214 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0157  regulatory protein RecX  34.15 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  31.58 
 
 		 221 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  28.33 
 
 		 191 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  35.64 
 
 		 212 aa  50.4  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  25.45 
 
 		 156 aa  50.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  35.64 
 
 		 212 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  31.11 
 
 		 214 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  34.07 
 
 		 199 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0412  recombination regulator RecX  29.25 
 
 		 258 aa  49.7  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  30 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  30.23 
 
 		 270 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  30.17 
 
 		 267 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  31.34 
 
 		 210 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  33.66 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2407  putative regulatory protein RecX  27.69 
 
 		 171 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.457695  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  35.29 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  30.34 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  36.36 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  30.77 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  26.67 
 
 		 184 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  27.56 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  32.22 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  30.77 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  26.28 
 
 		 179 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  26.85 
 
 		 271 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  29.82 
 
 		 222 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  26.36 
 
 		 254 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  29.03 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  34.48 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  35.23 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  31.52 
 
 		 257 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  32.95 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  30.43 
 
 		 220 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  32.22 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  28.87 
 
 		 217 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  24.73 
 
 		 151 aa  42.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  27.78 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  26.72 
 
 		 270 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0147  regulatory protein RecX  30.86 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  26.36 
 
 		 270 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  26.23 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  26.36 
 
 		 270 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  26.36 
 
 		 270 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  26.36 
 
 		 270 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  26.36 
 
 		 270 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  26.36 
 
 		 270 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  26.72 
 
 		 270 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  26.36 
 
 		 270 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  35.71 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3722  regulatory protein RecX  29.01 
 
 		 161 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.658929  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0422  recombination regulator RecX  29.25 
 
 		 258 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  32.63 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  34.88 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  28.06 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  35.71 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  31.48 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  31.11 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  31.48 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  25.69 
 
 		 271 aa  40.4  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  34 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  32.58 
 
 		 152 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>