46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0422 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0422  recombination regulator RecX  100 
 
 		 258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0412  recombination regulator RecX  57.75 
 
 		 258 aa  297  1e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  46.97 
 
 		 269 aa  221  8e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1411  recombination regulator RecX  32.57 
 
 		 267 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  31.4 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1961  recombination regulator RecX  32.32 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1927  recombination regulator RecX  32.32 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  29.96 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  29.62 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  29.81 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  29.62 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  30 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  29.62 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  29.62 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  25 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  29.62 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  29.23 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  29.62 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  29.23 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  27.91 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  25.32 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  28.43 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  26.54 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  22.98 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  23.58 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  26.5 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  26 
 
 		 159 aa  52.8  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  25.98 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4684  regulatory protein RecX  22.97 
 
 		 157 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  24.63 
 
 		 192 aa  48.9  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1119  regulatory protein RecX  31.65 
 
 		 188 aa  48.5  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0139  hypothetical protein  27.78 
 
 		 152 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  21.38 
 
 		 163 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  24.16 
 
 		 152 aa  46.2  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  23.57 
 
 		 151 aa  45.4  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  29.17 
 
 		 168 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1591  regulatory protein RecX  27.08 
 
 		 158 aa  44.3  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  24.32 
 
 		 184 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  24.06 
 
 		 191 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  27.84 
 
 		 152 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3955  regulatory protein RecX  22.54 
 
 		 168 aa  42.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  21.85 
 
 		 217 aa  42.7  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  23.13 
 
 		 154 aa  42.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  25.37 
 
 		 212 aa  42  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  25.37 
 
 		 212 aa  42  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  23.7 
 
 		 156 aa  42  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>