121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3105 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  100 
 
 		 164 aa  334  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  31.55 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  29.68 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  39.33 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  28.85 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  27.33 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  30.13 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  41.46 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  27.45 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  30.32 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0989  regulatory protein  28.75 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0882  regulatory protein RecX  28.75 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.119273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  28.39 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  25.31 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  26.62 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  30.52 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  29.56 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  41.18 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  29.25 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  27.1 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  27.38 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  26.14 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0441  regulatory protein RecX  28.75 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  32.71 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  30.58 
 
 		 222 aa  54.3  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  26.62 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  29.22 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  27.22 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  36.78 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  27.22 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  33 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  36.54 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  29.3 
 
 		 357 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  26.32 
 
 		 174 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  32.98 
 
 		 149 aa  51.2  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  25.97 
 
 		 214 aa  51.2  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  24.34 
 
 		 191 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2972  regulatory protein RecX  36.59 
 
 		 184 aa  50.8  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.439086  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3294  regulatory protein RecX  26.88 
 
 		 235 aa  50.8  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.808849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  33.65 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  21.71 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  28.1 
 
 		 269 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0273  recombination regulator RecX  23.75 
 
 		 327 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  24.07 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0973  recombination regulator RecX  23.75 
 
 		 327 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2040  recombination regulator RecX  27.27 
 
 		 297 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2651  recombination regulator RecX  27.27 
 
 		 297 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  28.32 
 
 		 220 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2673  recombination regulator RecX  23.75 
 
 		 327 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2403  recombination regulator RecX  23.75 
 
 		 327 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0811  recombination regulator RecX  23.75 
 
 		 327 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0815  recombination regulator RecX  23.75 
 
 		 327 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0016  recombination regulator RecX  23.75 
 
 		 327 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  20.39 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  20.39 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  32.58 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  25.58 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  25.33 
 
 		 207 aa  48.5  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  34.23 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  26.45 
 
 		 227 aa  48.5  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2680  recombination regulator RecX  27.92 
 
 		 302 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.521249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  28.05 
 
 		 270 aa  47.8  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  26.28 
 
 		 229 aa  47.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0672  regulatory protein RecX  25.62 
 
 		 235 aa  47.4  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 129 aa  47.4  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0644  recombination regulator RecX  25.62 
 
 		 325 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490193  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  26.51 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  32.56 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  24.71 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2438  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 213 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000098324  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0651  recombination regulator RecX  25.97 
 
 		 285 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2572  recombination regulator RecX  25.81 
 
 		 293 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  32.43 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  27.39 
 
 		 271 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  29.7 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  26.25 
 
 		 267 aa  45.8  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  29.03 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  22.36 
 
 		 228 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2407  putative regulatory protein RecX  46.94 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.457695  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  25.48 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  27.93 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  31.37 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  24.34 
 
 		 202 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  30 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  29.52 
 
 		 226 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  29.63 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  29.03 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  24.03 
 
 		 185 aa  44.7  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  26.49 
 
 		 212 aa  44.7  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2698  recombination regulator RecX  25.16 
 
 		 293 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5978  recombination regulator RecX  25.32 
 
 		 289 aa  44.3  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.129399 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0552  recombination regulator RecX  25.48 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  31.25 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 212 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0147  regulatory protein RecX  34.57 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0388  recX protein  24.67 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  34.52 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  28.26 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>