72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3293 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3293  regulatory protein RecX  100 
 
 		 150 aa  302  9.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  56.94 
 
 		 151 aa  173  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3722  regulatory protein RecX  47.45 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.658929  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  41.73 
 
 		 163 aa  123  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1022  regulatory protein RecX  49.62 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02685  putative transcriptional regulatory protein  44.44 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392987  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1030  regulatory protein RecX  44.29 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0807  regulatory protein RecX  39.31 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1167  hypothetical protein  36.96 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.254719 
 
 
-
 
NC_002950  PG0157  regulatory protein RecX  30.72 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  29.37 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  34.43 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  34.71 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  32.38 
 
 		 271 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  26.57 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  27.94 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  26.58 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  26.58 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  26.58 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  26.58 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  26.62 
 
 		 201 aa  52.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  26.12 
 
 		 206 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  24.14 
 
 		 214 aa  51.2  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  27.78 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  25.95 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  27.78 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  25.95 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  25.95 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  25.95 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  25.95 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  25.95 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  25.95 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  26.06 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  28.06 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  23.65 
 
 		 214 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  29.73 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  25.32 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  25 
 
 		 270 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  24.48 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  25 
 
 		 270 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  30.63 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  27.27 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  24.09 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  26.71 
 
 		 210 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  24.26 
 
 		 270 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  26.62 
 
 		 269 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  24.26 
 
 		 270 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  24.26 
 
 		 270 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  24.48 
 
 		 253 aa  44.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  24.26 
 
 		 270 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  24.26 
 
 		 270 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  24.26 
 
 		 270 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  24.26 
 
 		 270 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  24.26 
 
 		 270 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  25.93 
 
 		 202 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  26.36 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  26.95 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  23.02 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  29.9 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  22.73 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  30.85 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  23.94 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  23.77 
 
 		 154 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  25.71 
 
 		 168 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  24.14 
 
 		 271 aa  41.2  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  24.46 
 
 		 161 aa  41.2  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  23.74 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  24.82 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1411  recombination regulator RecX  24.65 
 
 		 267 aa  40.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  25.56 
 
 		 267 aa  40.4  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  26.09 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  22.9 
 
 		 269 aa  40.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>