112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0200 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0200  regulatory protein RecX  100 
 
 		 155 aa  293  8e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0164158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0147  regulatory protein RecX  66.89 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  44.67 
 
 		 152 aa  120  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  41.67 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  42.76 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  42.36 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  40 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  35.66 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2407  putative regulatory protein RecX  35.62 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.457695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  29.73 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  40.65 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  36.67 
 
 		 207 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  34.93 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  36.62 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  32.03 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  35.71 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2972  regulatory protein RecX  28.67 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.439086  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  34.93 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  28.38 
 
 		 220 aa  54.3  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  32.69 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  30.67 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  32.69 
 
 		 183 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  32.69 
 
 		 183 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  33.82 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  32.37 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  36.78 
 
 		 253 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  25.5 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  33.82 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  38.82 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  34.56 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  36.73 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  34.38 
 
 		 199 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  32 
 
 		 179 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1698  hypothetical protein  26.97 
 
 		 271 aa  49.7  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  31.25 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  31.47 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  31.47 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  30.07 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  34.12 
 
 		 214 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  29.45 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0157  regulatory protein RecX  27.7 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  30.53 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  30.53 
 
 		 214 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  31.58 
 
 		 214 aa  48.5  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  35.82 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  29.47 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  35.04 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  31.16 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  30.99 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  28.97 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 254 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  35.04 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  25.83 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  33.82 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  27.92 
 
 		 269 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  25.74 
 
 		 210 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  32.35 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  28.06 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  31.62 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  31.62 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  27.82 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  33.12 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  32.33 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  28.95 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  27.27 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  31.41 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  29.03 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  37.37 
 
 		 221 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  31.58 
 
 		 192 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  32.68 
 
 		 198 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  30.91 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  32.62 
 
 		 152 aa  44.3  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  30.91 
 
 		 166 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  30.91 
 
 		 166 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1595  regulatory protein RecX  34.48 
 
 		 269 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  28.08 
 
 		 184 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2558  hypothetical protein  32.24 
 
 		 181 aa  43.9  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.173611 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  31.33 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  32.39 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  29.73 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  28.18 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  34.78 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  28.07 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  34.04 
 
 		 271 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  30.3 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  30.3 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  33.72 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  30.3 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2438  regulatory protein RecX  26.71 
 
 		 213 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000098324  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  30.3 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3105  regulatory protein RecX  27.95 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201056  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  30.3 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  27.01 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  30.93 
 
 		 222 aa  42.4  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  27.4 
 
 		 150 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  31.3 
 
 		 137 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07470  hypothetical protein  27.27 
 
 		 233 aa  42  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0298056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  28.87 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  35.63 
 
 		 168 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  30.43 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>