90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2669 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2669  regulatory protein recX  100 
 
 		 168 aa  342  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  30.88 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3125  regulatory protein RecX  32.43 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3268  regulatory protein RecX  32.43 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3116  regulatory protein RecX  32.43 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  32.26 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  32.26 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  36.36 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  32.43 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  30.56 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  34.26 
 
 		 269 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  31.58 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  31.58 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  32.48 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  34.34 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  30.72 
 
 		 201 aa  52.4  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  26.35 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  27.59 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  32.46 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  32.73 
 
 		 210 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2746  regulatory protein RecX  30.63 
 
 		 137 aa  51.2  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  25.83 
 
 		 148 aa  50.8  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  30 
 
 		 152 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  26.72 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  29.2 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  26.72 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  26.83 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1832  regulatory protein RecX  32.11 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346429  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  27.62 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  25.89 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  32.65 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  28.71 
 
 		 145 aa  48.9  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  29.29 
 
 		 168 aa  47.8  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3947  regulatory protein RecX  23.7 
 
 		 153 aa  47.4  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  27.78 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1126  regulatory protein RecX  29.06 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  28.95 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1119  regulatory protein RecX  32.41 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  30.3 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1591  regulatory protein RecX  31.37 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  29.27 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  29.29 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  30.43 
 
 		 220 aa  45.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  31.58 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  28.26 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  30.3 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  30.3 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  29.08 
 
 		 222 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  30.39 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  26.72 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  28.26 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  25.23 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  30.3 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  30.3 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  30.3 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  28.28 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  28.28 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  30.3 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  30.3 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  30.3 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  30.3 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1127  regulatory protein RecX  27.97 
 
 		 123 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  28.28 
 
 		 166 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  28.12 
 
 		 166 aa  44.3  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  31.86 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  30.2 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  28.28 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3352  regulatory protein RecX  22.61 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0412  recombination regulator RecX  29.09 
 
 		 258 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  28.28 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4002  regulatory protein RecX  22.61 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.610217 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0639  regulatory protein RecX  27.68 
 
 		 198 aa  42.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  28.7 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  28.44 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3429  regulatory protein RecX  31.25 
 
 		 127 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4526  recombination regulator RecX  31.09 
 
 		 191 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  24.14 
 
 		 156 aa  42  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3614  regulatory protein RecX  27.45 
 
 		 177 aa  42  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0968404  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  26.36 
 
 		 152 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1509  regulatory protein RecX  29.29 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99842  normal  0.151917 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  28.04 
 
 		 153 aa  41.6  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3955  regulatory protein RecX  28.05 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2698  recombination regulator RecX  26.67 
 
 		 293 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4684  regulatory protein RecX  26.83 
 
 		 157 aa  41.2  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  29.92 
 
 		 154 aa  41.2  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4261  recombination regulator RecX  28.57 
 
 		 183 aa  40.8  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288884  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  29.91 
 
 		 222 aa  40.8  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>