More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2418 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  100 
 
 		 357 aa  739    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  73.31 
 
 		 357 aa  530  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  62.89 
 
 		 371 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  60.17 
 
 		 356 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  59.89 
 
 		 356 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  60.23 
 
 		 361 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  60.51 
 
 		 358 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  60.23 
 
 		 361 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  60 
 
 		 361 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  58.81 
 
 		 356 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  58.92 
 
 		 367 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  57.18 
 
 		 356 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  58.92 
 
 		 357 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  58.43 
 
 		 356 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  58.87 
 
 		 360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  55.31 
 
 		 359 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.1 
 
 		 365 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  58.81 
 
 		 365 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  57.63 
 
 		 366 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  56.06 
 
 		 359 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  54.83 
 
 		 364 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  59.4 
 
 		 365 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  58.54 
 
 		 357 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  59.94 
 
 		 365 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  58.61 
 
 		 358 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  57.26 
 
 		 367 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  54.5 
 
 		 366 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  60.38 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  58.51 
 
 		 365 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  56.46 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  60.31 
 
 		 365 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  59.81 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  54.57 
 
 		 365 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  52.05 
 
 		 384 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  54.42 
 
 		 371 aa  381  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  53.26 
 
 		 370 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  55.46 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  54.14 
 
 		 371 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  53.89 
 
 		 362 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  55.49 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  57.53 
 
 		 370 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  55.21 
 
 		 367 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  57.36 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  58.26 
 
 		 366 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  58.31 
 
 		 372 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  53.66 
 
 		 373 aa  372  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  51.79 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  48.04 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  43.05 
 
 		 379 aa  245  8e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  42.69 
 
 		 357 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  37.7 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  42.68 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  40.99 
 
 		 357 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  41.85 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  41.27 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.46 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  41.27 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4645  ABC transporter related  41.51 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.396966  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  39.38 
 
 		 355 aa  236  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.85 
 
 		 359 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5686  ABC transporter related  41.21 
 
 		 377 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.661701  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  38.2 
 
 		 368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  39 
 
 		 357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  39.58 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  37.61 
 
 		 357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.24 
 
 		 357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  37.78 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  39.32 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  40 
 
 		 389 aa  232  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  37.77 
 
 		 366 aa  232  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  40.12 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  38.66 
 
 		 354 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  37.85 
 
 		 354 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  39.71 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  37.46 
 
 		 355 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  42.07 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  39.3 
 
 		 363 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  37.78 
 
 		 355 aa  230  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4324  ABC transporter-related protein  40.17 
 
 		 361 aa  230  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.935984 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  40.12 
 
 		 356 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 		 386 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  37.82 
 
 		 354 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  37.54 
 
 		 358 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  41.59 
 
 		 357 aa  230  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  38.71 
 
 		 363 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  37.76 
 
 		 368 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  37.4 
 
 		 366 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.03 
 
 		 365 aa  229  6e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  39.26 
 
 		 350 aa  229  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0114  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.57 
 
 		 359 aa  229  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  42.07 
 
 		 332 aa  228  8e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  37.92 
 
 		 356 aa  229  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6630  ABC transporter related  40.61 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  39.36 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  39.45 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  40.38 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  38.24 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6367  ABC transporter related  37.57 
 
 		 371 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.114303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  39.56 
 
 		 385 aa  227  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5579  ABC transporter related  40.12 
 
 		 361 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.157659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>