More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2905 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  100 
 
 		 356 aa  731    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  80.9 
 
 		 356 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  80.34 
 
 		 356 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  77.56 
 
 		 364 aa  573  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  73.6 
 
 		 356 aa  553  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  73.31 
 
 		 358 aa  543  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  61.45 
 
 		 371 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  60.28 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  60.28 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  59.66 
 
 		 367 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  59.1 
 
 		 361 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  58.81 
 
 		 357 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  58.84 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  56.9 
 
 		 357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  56.98 
 
 		 359 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  57.81 
 
 		 367 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  56.16 
 
 		 360 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  55.34 
 
 		 365 aa  394  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  58.95 
 
 		 365 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  56.44 
 
 		 366 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  58.64 
 
 		 365 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  53.7 
 
 		 384 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  54.9 
 
 		 365 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  54.04 
 
 		 370 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  54.34 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  56.95 
 
 		 367 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  57.68 
 
 		 367 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.34 
 
 		 365 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  53.74 
 
 		 366 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  53.85 
 
 		 365 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  53.48 
 
 		 371 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  57.31 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  56.55 
 
 		 357 aa  381  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  55.95 
 
 		 357 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  53.2 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  56.07 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  55.19 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  54.46 
 
 		 356 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  58.07 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  50.82 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  55.12 
 
 		 358 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  52.72 
 
 		 373 aa  366  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  57.94 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  52.68 
 
 		 358 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  54.33 
 
 		 359 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  57.81 
 
 		 372 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  55.19 
 
 		 356 aa  358  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  51.56 
 
 		 365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  38.61 
 
 		 357 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  41.58 
 
 		 398 aa  242  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  38.41 
 
 		 355 aa  230  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  43 
 
 		 358 aa  230  3e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  37.12 
 
 		 353 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  40.32 
 
 		 355 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  40.18 
 
 		 357 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  37.46 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  40.32 
 
 		 363 aa  226  3e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  36.72 
 
 		 355 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  36.03 
 
 		 353 aa  226  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4034  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.48 
 
 		 352 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  37.22 
 
 		 353 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  38.84 
 
 		 352 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  40.14 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  37.22 
 
 		 353 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  38.18 
 
 		 356 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  40.48 
 
 		 370 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  41.27 
 
 		 362 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  38.96 
 
 		 353 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  38.28 
 
 		 363 aa  222  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  39.22 
 
 		 356 aa  222  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2095  ABC transporter related  38.51 
 
 		 368 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  37.95 
 
 		 371 aa  222  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  38.15 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  38.94 
 
 		 403 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  38.65 
 
 		 353 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  38.21 
 
 		 363 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  40.4 
 
 		 366 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  35.2 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4985  ABC transporter related  39.33 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5504  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  35.61 
 
 		 381 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0655  ABC transporter related  39.07 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.22105 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  38.27 
 
 		 363 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  33.88 
 
 		 359 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  37.06 
 
 		 357 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  36.9 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  37.86 
 
 		 369 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  36.26 
 
 		 356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  37.28 
 
 		 354 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 		 366 aa  219  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 		 366 aa  219  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  37.13 
 
 		 354 aa  219  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0225  ABC transporter related  38.87 
 
 		 349 aa  219  6e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.676299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  38.73 
 
 		 352 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  39.8 
 
 		 367 aa  219  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  39.8 
 
 		 367 aa  219  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  34.86 
 
 		 351 aa  219  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00570  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  37.81 
 
 		 379 aa  218  8.999999999999998e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.26 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.26 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>