More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2099 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  100 
 
 		 365 aa  751    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  52.78 
 
 		 359 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  51.65 
 
 		 384 aa  355  6.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  52.66 
 
 		 369 aa  349  4e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  52.52 
 
 		 365 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 		 365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  51.78 
 
 		 366 aa  342  5.999999999999999e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  51.93 
 
 		 365 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  51.63 
 
 		 365 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  51.73 
 
 		 365 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  48.04 
 
 		 357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  49.05 
 
 		 367 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  48.75 
 
 		 357 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  49.72 
 
 		 367 aa  335  9e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  49.3 
 
 		 367 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  51.58 
 
 		 358 aa  333  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  51.33 
 
 		 365 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  50.59 
 
 		 370 aa  333  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  50.74 
 
 		 371 aa  332  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  47.53 
 
 		 360 aa  332  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  50.72 
 
 		 362 aa  332  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  50.86 
 
 		 365 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  48.47 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  49.85 
 
 		 371 aa  328  9e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  51.56 
 
 		 356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  50.9 
 
 		 360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  51.42 
 
 		 365 aa  327  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  51.79 
 
 		 356 aa  326  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  52.02 
 
 		 356 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  52.65 
 
 		 356 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  50.29 
 
 		 357 aa  324  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  52.32 
 
 		 370 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  51.78 
 
 		 357 aa  323  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  50.31 
 
 		 356 aa  319  5e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  52.65 
 
 		 361 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  46.7 
 
 		 371 aa  316  4e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  52.34 
 
 		 361 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  52.17 
 
 		 361 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  49.86 
 
 		 358 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  46.65 
 
 		 364 aa  311  7.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  48.6 
 
 		 360 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  50.93 
 
 		 358 aa  310  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  51.54 
 
 		 372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  45.43 
 
 		 373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  51.08 
 
 		 367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  49.28 
 
 		 359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  47.9 
 
 		 366 aa  295  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  51.85 
 
 		 356 aa  292  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  38.57 
 
 		 354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  40.96 
 
 		 352 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  39.47 
 
 		 368 aa  239  6.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  36.89 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  37.53 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  36.89 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  37.26 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  42.39 
 
 		 371 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  41.61 
 
 		 364 aa  236  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  37.77 
 
 		 367 aa  233  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  37.77 
 
 		 367 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  34.7 
 
 		 367 aa  233  3e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 		 366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  35.79 
 
 		 369 aa  233  4.0000000000000004e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  39.62 
 
 		 375 aa  233  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  36.29 
 
 		 370 aa  233  6e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2648  ABC transporter related protein  37.16 
 
 		 378 aa  232  6e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  35.89 
 
 		 370 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.46 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 		 366 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  37.17 
 
 		 364 aa  230  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  37.64 
 
 		 361 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  35.16 
 
 		 378 aa  229  5e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  38.64 
 
 		 356 aa  229  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  36.87 
 
 		 364 aa  228  8e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2068  ABC transporter related  38.23 
 
 		 364 aa  228  9e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  36.87 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  38.3 
 
 		 353 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  35.48 
 
 		 369 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  38.89 
 
 		 370 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  36.87 
 
 		 364 aa  227  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  36.07 
 
 		 402 aa  226  4e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  36.16 
 
 		 367 aa  226  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  36.39 
 
 		 376 aa  225  7e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3778  ABC transporter related  36.67 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.37317  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  33.15 
 
 		 365 aa  223  3e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  35.5 
 
 		 402 aa  223  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  36.68 
 
 		 374 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  39.46 
 
 		 358 aa  223  6e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  40.92 
 
 		 353 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3225  ABC transporter related  35.26 
 
 		 373 aa  222  7e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  38.96 
 
 		 367 aa  222  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  39.26 
 
 		 367 aa  222  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0207  ABC transporter related  37.71 
 
 		 375 aa  222  8e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.19 
 
 		 356 aa  222  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>