More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5368 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  100 
 
 		 370 aa  762    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  80.56 
 
 		 362 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  74.1 
 
 		 365 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  74.18 
 
 		 365 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  73 
 
 		 365 aa  532  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  59 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  57.58 
 
 		 357 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  56.2 
 
 		 357 aa  423  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  58.06 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  57.3 
 
 		 359 aa  413  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  56.46 
 
 		 359 aa  411  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  55.37 
 
 		 358 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  53.95 
 
 		 371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  57.3 
 
 		 356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  55.71 
 
 		 366 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  57.93 
 
 		 365 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  55.46 
 
 		 372 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  53.68 
 
 		 371 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  52.62 
 
 		 365 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  55.03 
 
 		 365 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  52.59 
 
 		 384 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.03 
 
 		 365 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  52.23 
 
 		 370 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  52.89 
 
 		 366 aa  394  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  55.87 
 
 		 365 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  53.72 
 
 		 358 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  56.31 
 
 		 356 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  54.7 
 
 		 361 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  52.55 
 
 		 373 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  54.73 
 
 		 369 aa  383  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  54.97 
 
 		 361 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  57.19 
 
 		 356 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  53.97 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  57.53 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  53.17 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  58.07 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  56.53 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  53.46 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  54.64 
 
 		 367 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  55.92 
 
 		 367 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  55.31 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  55.25 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  53.87 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  58.26 
 
 		 357 aa  364  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  53.99 
 
 		 367 aa  362  5.0000000000000005e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  58.33 
 
 		 360 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  55.31 
 
 		 364 aa  355  7.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  52.32 
 
 		 365 aa  323  3e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  39.75 
 
 		 357 aa  225  8e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3666  ABC transporter related  36.78 
 
 		 365 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4866  ABC transporter related  36.21 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.112341 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.66 
 
 		 359 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  37.91 
 
 		 357 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  35.58 
 
 		 375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  41.18 
 
 		 356 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  38.76 
 
 		 359 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  37.22 
 
 		 360 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  33.78 
 
 		 370 aa  215  9e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.84 
 
 		 357 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  38.03 
 
 		 366 aa  215  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  35.56 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0170  ABC transporter related protein  35.44 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  40 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  38.98 
 
 		 373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  35.56 
 
 		 386 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  39.62 
 
 		 362 aa  212  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  37.58 
 
 		 425 aa  213  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  38.46 
 
 		 381 aa  212  9e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  38.55 
 
 		 353 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  36.44 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0077  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.57 
 
 		 365 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2080  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.8 
 
 		 378 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  36.31 
 
 		 357 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  38.12 
 
 		 365 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2430  ABC transporter related  36.39 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0752854  normal  0.820475 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  35.97 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  38.41 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  39.16 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  37.58 
 
 		 370 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.68 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4324  ABC transporter-related protein  37.54 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.935984 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.6 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  38.44 
 
 		 365 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  38.04 
 
 		 389 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  36.09 
 
 		 371 aa  210  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4985  ABC transporter related  36.13 
 
 		 369 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.15 
 
 		 365 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3453  ABC transporter related  36.94 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3576  ABC transporter related  37.89 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  37.15 
 
 		 375 aa  209  6e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.04 
 
 		 365 aa  209  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  36.83 
 
 		 376 aa  209  7e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.81 
 
 		 363 aa  209  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  38.65 
 
 		 386 aa  209  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  36.53 
 
 		 375 aa  209  8e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5884  ABC transporter related  40.14 
 
 		 393 aa  209  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  36.26 
 
 		 357 aa  208  9e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  35.14 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  36.84 
 
 		 363 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2845  ABC transporter related  36.49 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.649643  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>