More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4067 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4215  ABC transporter related  92.64 
 
 		 367 aa  692    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4067  ABC transporter related  100 
 
 		 367 aa  741    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.622569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4893  ABC transporter related  87.19 
 
 		 366 aa  651    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1363  ABC transporter related  84.74 
 
 		 367 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.349781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2223  putative ATP-binding protein of sugar ABC transporter  78.61 
 
 		 360 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0239428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1973  ABC transporter related  69.06 
 
 		 360 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5981  ABC transporter related  59.05 
 
 		 356 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4103  ABC transporter related  57.63 
 
 		 371 aa  401  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.46789 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  54.14 
 
 		 359 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4391  ABC transporter related  59.6 
 
 		 367 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6468  ABC transporter related  57.66 
 
 		 356 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3129  sugar ABC transporter  56.94 
 
 		 357 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1206  ABC transporter related  58.5 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1325  ABC transporter related  58.31 
 
 		 361 aa  391  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3329  ABC transporter related  54.67 
 
 		 365 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2982  ABC transporter related  55.22 
 
 		 365 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2667  ABC sugar (glycerol) transporter, ATPase subunit  58.03 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0376  ABC transporter related  56.51 
 
 		 356 aa  388  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.118404  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2905  ABC transporter related  57.68 
 
 		 356 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1593  ABC transporter related  58.13 
 
 		 358 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1026  ABC transporter related  55 
 
 		 360 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0385  ABC transporter related  55.68 
 
 		 357 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3047  ABC transporter ATP-binding protein  54.4 
 
 		 365 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2418  ABC transporter related  55.21 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403436  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0096  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  57.94 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3477  ABC transporter related  53.28 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3978  ABC transporter related  55.77 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264187  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3395  ABC transporter related  56.79 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0605  ABC transporter-related protein  58.79 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2261  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.15 
 
 		 365 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082642 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5368  ABC transporter related  55.92 
 
 		 370 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.294275 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2321  ABC transporter related  54.02 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.776041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2043  ABC transporter related  51.52 
 
 		 365 aa  371  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.666942  normal  0.570624 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3675  ABC transporter related  54.85 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0294944  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2093  ABC transporter related  52.33 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2233  ABC transporter-related protein  61.27 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150035  normal  0.188564 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6728  ABC transporter related  52.7 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.928651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1734  ABC transporter related  55.79 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712838  normal  0.481204 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0379  ABC transporter related  50.95 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1894  ABC transporter related  52.19 
 
 		 365 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0479  ABC transporter related  53.46 
 
 		 359 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00491956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3634  ABC transporter-like  49.73 
 
 		 370 aa  358  6e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3739  ABC transporter, ATP-binding protein  49.46 
 
 		 371 aa  358  7e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0767188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5937  ABC transporter related protein  52.27 
 
 		 373 aa  358  9e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.493083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2208  ABC transporter related  60.94 
 
 		 372 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1738  ABC transporter  49.46 
 
 		 371 aa  356  5e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3173  ABC transporter ATP-binding protein  48.76 
 
 		 369 aa  347  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2099  ABC transporter related  49.72 
 
 		 365 aa  335  9e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0897069 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 374 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  39.34 
 
 		 357 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  40.58 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  37.28 
 
 		 373 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  37.6 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.48 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  43.96 
 
 		 359 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  39.46 
 
 		 338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  41.18 
 
 		 357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  37.33 
 
 		 386 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  44.03 
 
 		 356 aa  232  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  38.5 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  37.81 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  37.77 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  37.36 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9197  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.18 
 
 		 359 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  41.48 
 
 		 356 aa  229  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  40.67 
 
 		 363 aa  229  8e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  41.52 
 
 		 359 aa  228  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  37.36 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  37.09 
 
 		 357 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  37.36 
 
 		 384 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2833  ABC transporter related  38.95 
 
 		 415 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  37.6 
 
 		 348 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  37.09 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  38.55 
 
 		 353 aa  226  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  37.2 
 
 		 368 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  41.03 
 
 		 372 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  37.11 
 
 		 386 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  42.67 
 
 		 365 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  38.81 
 
 		 353 aa  226  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  36.79 
 
 		 370 aa  226  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  37.83 
 
 		 369 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  39.82 
 
 		 332 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  38.42 
 
 		 349 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  39.3 
 
 		 367 aa  224  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  41.34 
 
 		 398 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  36.44 
 
 		 371 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  39.4 
 
 		 352 aa  224  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  37.33 
 
 		 348 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  39.3 
 
 		 367 aa  224  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  37.33 
 
 		 348 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5207  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  40.31 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.575313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  38.35 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  41.53 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  38.23 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  39.76 
 
 		 372 aa  223  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1087  ABC transporter related  38.19 
 
 		 365 aa  224  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  38.95 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  37.68 
 
 		 357 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1694  ABC transporter related  39.77 
 
 		 341 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.923291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  36.24 
 
 		 378 aa  223  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>